Protein–RNA interactions for Protein: E9PVL6

Trim30b, Tripartite motif-containing 30B, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30bE9PVL6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Trim30bE9PVL6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Trim30bE9PVL6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Trim30bE9PVL6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Trim30bE9PVL6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Trim30bE9PVL6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Trim30bE9PVL6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Trim30bE9PVL6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Trim30bE9PVL6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Trim30bE9PVL6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Trim30bE9PVL6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Trim30bE9PVL6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Trim30bE9PVL6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Trim30bE9PVL6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Trim30bE9PVL6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Trim30bE9PVL6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Trim30bE9PVL6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Trim30bE9PVL6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Trim30bE9PVL6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Trim30bE9PVL6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Trim30bE9PVL6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Trim30bE9PVL6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Trim30bE9PVL6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Trim30bE9PVL6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Trim30bE9PVL6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Trim30bE9PVL6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Trim30bE9PVL6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Trim30bE9PVL6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Trim30bE9PVL6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Trim30bE9PVL6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Trim30bE9PVL6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Trim30bE9PVL6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Trim30bE9PVL6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Trim30bE9PVL6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Trim30bE9PVL6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Trim30bE9PVL6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Trim30bE9PVL6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Trim30bE9PVL6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Trim30bE9PVL6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Trim30bE9PVL6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Trim30bE9PVL6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Trim30bE9PVL6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Trim30bE9PVL6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Trim30bE9PVL6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Trim30bE9PVL6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Trim30bE9PVL6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Trim30bE9PVL6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Trim30bE9PVL6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Trim30bE9PVL6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Trim30bE9PVL6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Trim30bE9PVL6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Trim30bE9PVL6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Trim30bE9PVL6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Trim30bE9PVL6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Trim30bE9PVL6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Trim30bE9PVL6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Trim30bE9PVL6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Trim30bE9PVL6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Trim30bE9PVL6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Trim30bE9PVL6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Trim30bE9PVL6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Trim30bE9PVL6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Trim30bE9PVL6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Trim30bE9PVL6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Trim30bE9PVL6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Trim30bE9PVL6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Trim30bE9PVL6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Trim30bE9PVL6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Trim30bE9PVL6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Trim30bE9PVL6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Trim30bE9PVL6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Trim30bE9PVL6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Trim30bE9PVL6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Trim30bE9PVL6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Trim30bE9PVL6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Trim30bE9PVL6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trim30bE9PVL6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trim30bE9PVL6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Trim30bE9PVL6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Trim30bE9PVL6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Trim30bE9PVL6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Trim30bE9PVL6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Trim30bE9PVL6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trim30bE9PVL6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Trim30bE9PVL6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trim30bE9PVL6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trim30bE9PVL6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Trim30bE9PVL6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trim30bE9PVL6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Trim30bE9PVL6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Trim30bE9PVL6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trim30bE9PVL6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trim30bE9PVL6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trim30bE9PVL6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Trim30bE9PVL6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trim30bE9PVL6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trim30bE9PVL6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trim30bE9PVL6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Trim30bE9PVL6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Trim30bE9PVL6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms