Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6L3

Vmn2r49, Vomeronasal 2, receptor 49, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r49D3Z6L3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vmn2r49D3Z6L3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Vmn2r49D3Z6L3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vmn2r49D3Z6L3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vmn2r49D3Z6L3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vmn2r49D3Z6L3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vmn2r49D3Z6L3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vmn2r49D3Z6L3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vmn2r49D3Z6L3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Vmn2r49D3Z6L3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vmn2r49D3Z6L3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vmn2r49D3Z6L3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vmn2r49D3Z6L3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vmn2r49D3Z6L3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vmn2r49D3Z6L3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vmn2r49D3Z6L3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vmn2r49D3Z6L3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Vmn2r49D3Z6L3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vmn2r49D3Z6L3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vmn2r49D3Z6L3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vmn2r49D3Z6L3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vmn2r49D3Z6L3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vmn2r49D3Z6L3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vmn2r49D3Z6L3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vmn2r49D3Z6L3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vmn2r49D3Z6L3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Vmn2r49D3Z6L3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vmn2r49D3Z6L3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vmn2r49D3Z6L3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vmn2r49D3Z6L3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vmn2r49D3Z6L3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vmn2r49D3Z6L3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vmn2r49D3Z6L3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vmn2r49D3Z6L3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vmn2r49D3Z6L3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vmn2r49D3Z6L3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vmn2r49D3Z6L3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vmn2r49D3Z6L3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vmn2r49D3Z6L3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vmn2r49D3Z6L3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vmn2r49D3Z6L3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vmn2r49D3Z6L3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vmn2r49D3Z6L3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vmn2r49D3Z6L3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vmn2r49D3Z6L3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vmn2r49D3Z6L3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vmn2r49D3Z6L3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vmn2r49D3Z6L3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vmn2r49D3Z6L3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vmn2r49D3Z6L3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vmn2r49D3Z6L3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vmn2r49D3Z6L3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vmn2r49D3Z6L3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vmn2r49D3Z6L3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vmn2r49D3Z6L3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vmn2r49D3Z6L3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vmn2r49D3Z6L3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Vmn2r49D3Z6L3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vmn2r49D3Z6L3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vmn2r49D3Z6L3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vmn2r49D3Z6L3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vmn2r49D3Z6L3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vmn2r49D3Z6L3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vmn2r49D3Z6L3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vmn2r49D3Z6L3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Vmn2r49D3Z6L3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vmn2r49D3Z6L3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vmn2r49D3Z6L3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Vmn2r49D3Z6L3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vmn2r49D3Z6L3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vmn2r49D3Z6L3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vmn2r49D3Z6L3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Vmn2r49D3Z6L3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vmn2r49D3Z6L3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vmn2r49D3Z6L3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vmn2r49D3Z6L3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vmn2r49D3Z6L3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Vmn2r49D3Z6L3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vmn2r49D3Z6L3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vmn2r49D3Z6L3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vmn2r49D3Z6L3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vmn2r49D3Z6L3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vmn2r49D3Z6L3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Vmn2r49D3Z6L3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vmn2r49D3Z6L3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vmn2r49D3Z6L3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vmn2r49D3Z6L3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vmn2r49D3Z6L3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vmn2r49D3Z6L3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Vmn2r49D3Z6L3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vmn2r49D3Z6L3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vmn2r49D3Z6L3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vmn2r49D3Z6L3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vmn2r49D3Z6L3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vmn2r49D3Z6L3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vmn2r49D3Z6L3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vmn2r49D3Z6L3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vmn2r49D3Z6L3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vmn2r49D3Z6L3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Vmn2r49D3Z6L3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.7 ms