Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc8D3YZV8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc8D3YZV8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc8D3YZV8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc8D3YZV8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ccdc8D3YZV8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc8D3YZV8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc8D3YZV8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc8D3YZV8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc8D3YZV8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc8D3YZV8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc8D3YZV8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc8D3YZV8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc8D3YZV8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc8D3YZV8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc8D3YZV8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc8D3YZV8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc8D3YZV8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ccdc8D3YZV8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccdc8D3YZV8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccdc8D3YZV8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Ccdc8D3YZV8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc8D3YZV8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc8D3YZV8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc8D3YZV8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc8D3YZV8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc8D3YZV8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc8D3YZV8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc8D3YZV8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc8D3YZV8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc8D3YZV8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc8D3YZV8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc8D3YZV8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc8D3YZV8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc8D3YZV8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc8D3YZV8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc8D3YZV8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc8D3YZV8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc8D3YZV8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc8D3YZV8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc8D3YZV8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc8D3YZV8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc8D3YZV8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc8D3YZV8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc8D3YZV8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc8D3YZV8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc8D3YZV8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc8D3YZV8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc8D3YZV8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc8D3YZV8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc8D3YZV8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc8D3YZV8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc8D3YZV8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc8D3YZV8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc8D3YZV8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc8D3YZV8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc8D3YZV8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc8D3YZV8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc8D3YZV8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc8D3YZV8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc8D3YZV8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Ccdc8D3YZV8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc8D3YZV8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc8D3YZV8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc8D3YZV8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc8D3YZV8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc8D3YZV8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc8D3YZV8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc8D3YZV8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc8D3YZV8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc8D3YZV8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc8D3YZV8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc8D3YZV8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc8D3YZV8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc8D3YZV8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc8D3YZV8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc8D3YZV8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc8D3YZV8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc8D3YZV8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc8D3YZV8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc8D3YZV8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc8D3YZV8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc8D3YZV8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc8D3YZV8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc8D3YZV8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc8D3YZV8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc8D3YZV8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc8D3YZV8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc8D3YZV8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc8D3YZV8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc8D3YZV8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc8D3YZV8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc8D3YZV8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc8D3YZV8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc8D3YZV8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc8D3YZV8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc8D3YZV8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc8D3YZV8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc8D3YZV8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc8D3YZV8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.7 ms