Protein–RNA interactions for Protein: D3YV89

Mmp27, Matrix metalloproteinase, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp27D3YV89 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mmp27D3YV89 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mmp27D3YV89 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mmp27D3YV89 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mmp27D3YV89 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mmp27D3YV89 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mmp27D3YV89 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mmp27D3YV89 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mmp27D3YV89 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mmp27D3YV89 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mmp27D3YV89 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mmp27D3YV89 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mmp27D3YV89 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mmp27D3YV89 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mmp27D3YV89 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mmp27D3YV89 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mmp27D3YV89 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mmp27D3YV89 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mmp27D3YV89 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mmp27D3YV89 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mmp27D3YV89 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mmp27D3YV89 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Mmp27D3YV89 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mmp27D3YV89 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mmp27D3YV89 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mmp27D3YV89 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mmp27D3YV89 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mmp27D3YV89 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mmp27D3YV89 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mmp27D3YV89 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mmp27D3YV89 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mmp27D3YV89 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mmp27D3YV89 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mmp27D3YV89 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mmp27D3YV89 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mmp27D3YV89 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mmp27D3YV89 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Mmp27D3YV89 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Mmp27D3YV89 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mmp27D3YV89 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mmp27D3YV89 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Mmp27D3YV89 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mmp27D3YV89 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mmp27D3YV89 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mmp27D3YV89 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mmp27D3YV89 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mmp27D3YV89 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mmp27D3YV89 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mmp27D3YV89 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mmp27D3YV89 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mmp27D3YV89 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mmp27D3YV89 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mmp27D3YV89 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mmp27D3YV89 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mmp27D3YV89 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mmp27D3YV89 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mmp27D3YV89 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mmp27D3YV89 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mmp27D3YV89 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mmp27D3YV89 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mmp27D3YV89 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mmp27D3YV89 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mmp27D3YV89 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mmp27D3YV89 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mmp27D3YV89 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mmp27D3YV89 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mmp27D3YV89 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mmp27D3YV89 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mmp27D3YV89 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mmp27D3YV89 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Mmp27D3YV89 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mmp27D3YV89 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mmp27D3YV89 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mmp27D3YV89 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mmp27D3YV89 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mmp27D3YV89 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mmp27D3YV89 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mmp27D3YV89 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mmp27D3YV89 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mmp27D3YV89 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mmp27D3YV89 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mmp27D3YV89 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mmp27D3YV89 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mmp27D3YV89 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mmp27D3YV89 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mmp27D3YV89 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mmp27D3YV89 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mmp27D3YV89 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mmp27D3YV89 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mmp27D3YV89 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mmp27D3YV89 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mmp27D3YV89 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mmp27D3YV89 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mmp27D3YV89 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Mmp27D3YV89 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mmp27D3YV89 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mmp27D3YV89 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mmp27D3YV89 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mmp27D3YV89 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mmp27D3YV89 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms