Protein–RNA interactions for Protein: B9EKE5

Catip, Ciliogenesis-associated TTC17-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatipB9EKE5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
CatipB9EKE5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
CatipB9EKE5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
CatipB9EKE5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CatipB9EKE5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
CatipB9EKE5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
CatipB9EKE5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
CatipB9EKE5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
CatipB9EKE5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
CatipB9EKE5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
CatipB9EKE5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
CatipB9EKE5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
CatipB9EKE5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
CatipB9EKE5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
CatipB9EKE5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
CatipB9EKE5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
CatipB9EKE5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
CatipB9EKE5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
CatipB9EKE5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CatipB9EKE5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
CatipB9EKE5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
CatipB9EKE5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CatipB9EKE5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CatipB9EKE5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
CatipB9EKE5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
CatipB9EKE5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
CatipB9EKE5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
CatipB9EKE5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC37.67■■■■□ 3.62
CatipB9EKE5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
CatipB9EKE5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
CatipB9EKE5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CatipB9EKE5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC37.49■■■■□ 3.59
CatipB9EKE5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
CatipB9EKE5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CatipB9EKE5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
CatipB9EKE5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
CatipB9EKE5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
CatipB9EKE5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
CatipB9EKE5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
CatipB9EKE5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
CatipB9EKE5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
CatipB9EKE5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
CatipB9EKE5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
CatipB9EKE5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CatipB9EKE5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CatipB9EKE5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
CatipB9EKE5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CatipB9EKE5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
CatipB9EKE5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CatipB9EKE5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CatipB9EKE5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CatipB9EKE5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CatipB9EKE5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CatipB9EKE5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CatipB9EKE5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
CatipB9EKE5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
CatipB9EKE5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
CatipB9EKE5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
CatipB9EKE5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
CatipB9EKE5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
CatipB9EKE5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
CatipB9EKE5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
CatipB9EKE5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.5
CatipB9EKE5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
CatipB9EKE5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CatipB9EKE5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CatipB9EKE5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CatipB9EKE5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CatipB9EKE5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CatipB9EKE5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
CatipB9EKE5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CatipB9EKE5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CatipB9EKE5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
CatipB9EKE5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
CatipB9EKE5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CatipB9EKE5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CatipB9EKE5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CatipB9EKE5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CatipB9EKE5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
CatipB9EKE5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC36.57■■■■□ 3.45
CatipB9EKE5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
CatipB9EKE5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CatipB9EKE5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
CatipB9EKE5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
CatipB9EKE5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CatipB9EKE5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CatipB9EKE5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
CatipB9EKE5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CatipB9EKE5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CatipB9EKE5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CatipB9EKE5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CatipB9EKE5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CatipB9EKE5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CatipB9EKE5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
CatipB9EKE5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CatipB9EKE5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CatipB9EKE5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
CatipB9EKE5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CatipB9EKE5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CatipB9EKE5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC36.26■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms