Protein–RNA interactions for Protein: B1AVK5

Col4a6, Collagen, type IV, alpha 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a6B1AVK5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Col4a6B1AVK5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Col4a6B1AVK5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Col4a6B1AVK5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Col4a6B1AVK5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Col4a6B1AVK5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Col4a6B1AVK5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Col4a6B1AVK5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Col4a6B1AVK5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Col4a6B1AVK5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Col4a6B1AVK5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Col4a6B1AVK5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Col4a6B1AVK5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Col4a6B1AVK5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Col4a6B1AVK5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Col4a6B1AVK5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Col4a6B1AVK5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Col4a6B1AVK5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Col4a6B1AVK5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Col4a6B1AVK5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Col4a6B1AVK5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Col4a6B1AVK5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Col4a6B1AVK5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Col4a6B1AVK5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Col4a6B1AVK5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Col4a6B1AVK5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Col4a6B1AVK5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Col4a6B1AVK5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Col4a6B1AVK5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Col4a6B1AVK5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Col4a6B1AVK5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Col4a6B1AVK5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Col4a6B1AVK5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Col4a6B1AVK5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Col4a6B1AVK5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Col4a6B1AVK5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Col4a6B1AVK5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Col4a6B1AVK5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Col4a6B1AVK5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Col4a6B1AVK5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Col4a6B1AVK5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Col4a6B1AVK5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Col4a6B1AVK5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Col4a6B1AVK5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Col4a6B1AVK5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Col4a6B1AVK5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Col4a6B1AVK5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Col4a6B1AVK5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Col4a6B1AVK5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Col4a6B1AVK5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Col4a6B1AVK5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Col4a6B1AVK5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Col4a6B1AVK5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Col4a6B1AVK5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Col4a6B1AVK5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Col4a6B1AVK5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Col4a6B1AVK5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Col4a6B1AVK5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Col4a6B1AVK5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Col4a6B1AVK5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Col4a6B1AVK5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Col4a6B1AVK5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Col4a6B1AVK5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Col4a6B1AVK5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Col4a6B1AVK5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Col4a6B1AVK5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Col4a6B1AVK5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Col4a6B1AVK5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Col4a6B1AVK5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Col4a6B1AVK5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Col4a6B1AVK5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Col4a6B1AVK5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Col4a6B1AVK5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Col4a6B1AVK5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Col4a6B1AVK5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Col4a6B1AVK5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Col4a6B1AVK5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Col4a6B1AVK5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Col4a6B1AVK5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Col4a6B1AVK5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Col4a6B1AVK5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Col4a6B1AVK5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Col4a6B1AVK5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Col4a6B1AVK5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Col4a6B1AVK5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Col4a6B1AVK5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Col4a6B1AVK5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Col4a6B1AVK5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Col4a6B1AVK5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Col4a6B1AVK5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Col4a6B1AVK5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Col4a6B1AVK5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Col4a6B1AVK5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Col4a6B1AVK5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Col4a6B1AVK5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Col4a6B1AVK5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Col4a6B1AVK5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Col4a6B1AVK5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Col4a6B1AVK5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Col4a6B1AVK5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms