Protein–RNA interactions for Protein: B1AQL3

Tmem235, Transmembrane protein 235, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem235B1AQL3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tmem235B1AQL3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Tmem235B1AQL3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tmem235B1AQL3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Tmem235B1AQL3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tmem235B1AQL3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tmem235B1AQL3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tmem235B1AQL3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tmem235B1AQL3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tmem235B1AQL3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tmem235B1AQL3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tmem235B1AQL3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Tmem235B1AQL3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tmem235B1AQL3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tmem235B1AQL3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tmem235B1AQL3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tmem235B1AQL3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tmem235B1AQL3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tmem235B1AQL3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tmem235B1AQL3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Tmem235B1AQL3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tmem235B1AQL3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tmem235B1AQL3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tmem235B1AQL3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tmem235B1AQL3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tmem235B1AQL3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tmem235B1AQL3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tmem235B1AQL3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tmem235B1AQL3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tmem235B1AQL3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tmem235B1AQL3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tmem235B1AQL3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tmem235B1AQL3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tmem235B1AQL3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tmem235B1AQL3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tmem235B1AQL3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tmem235B1AQL3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tmem235B1AQL3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tmem235B1AQL3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Tmem235B1AQL3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Tmem235B1AQL3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tmem235B1AQL3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tmem235B1AQL3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Tmem235B1AQL3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tmem235B1AQL3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tmem235B1AQL3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tmem235B1AQL3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tmem235B1AQL3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tmem235B1AQL3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tmem235B1AQL3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tmem235B1AQL3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tmem235B1AQL3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tmem235B1AQL3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tmem235B1AQL3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tmem235B1AQL3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Tmem235B1AQL3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tmem235B1AQL3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tmem235B1AQL3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Tmem235B1AQL3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tmem235B1AQL3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tmem235B1AQL3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tmem235B1AQL3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tmem235B1AQL3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tmem235B1AQL3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Tmem235B1AQL3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tmem235B1AQL3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tmem235B1AQL3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tmem235B1AQL3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tmem235B1AQL3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tmem235B1AQL3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Tmem235B1AQL3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tmem235B1AQL3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tmem235B1AQL3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tmem235B1AQL3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tmem235B1AQL3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tmem235B1AQL3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tmem235B1AQL3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tmem235B1AQL3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tmem235B1AQL3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tmem235B1AQL3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tmem235B1AQL3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Tmem235B1AQL3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tmem235B1AQL3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tmem235B1AQL3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tmem235B1AQL3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tmem235B1AQL3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Tmem235B1AQL3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Tmem235B1AQL3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tmem235B1AQL3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tmem235B1AQL3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Tmem235B1AQL3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tmem235B1AQL3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tmem235B1AQL3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tmem235B1AQL3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tmem235B1AQL3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tmem235B1AQL3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tmem235B1AQL3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tmem235B1AQL3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tmem235B1AQL3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tmem235B1AQL3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
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