Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H2-M5A7VMS3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H2-M5A7VMS3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2-M5A7VMS3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
H2-M5A7VMS3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2-M5A7VMS3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2-M5A7VMS3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2-M5A7VMS3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2-M5A7VMS3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
H2-M5A7VMS3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2-M5A7VMS3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2-M5A7VMS3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H2-M5A7VMS3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
H2-M5A7VMS3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
H2-M5A7VMS3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2-M5A7VMS3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2-M5A7VMS3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2-M5A7VMS3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2-M5A7VMS3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2-M5A7VMS3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
H2-M5A7VMS3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2-M5A7VMS3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2-M5A7VMS3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2-M5A7VMS3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
H2-M5A7VMS3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2-M5A7VMS3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2-M5A7VMS3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
H2-M5A7VMS3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2-M5A7VMS3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2-M5A7VMS3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2-M5A7VMS3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
H2-M5A7VMS3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2-M5A7VMS3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H2-M5A7VMS3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H2-M5A7VMS3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H2-M5A7VMS3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H2-M5A7VMS3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2-M5A7VMS3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H2-M5A7VMS3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2-M5A7VMS3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2-M5A7VMS3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2-M5A7VMS3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2-M5A7VMS3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2-M5A7VMS3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2-M5A7VMS3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2-M5A7VMS3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2-M5A7VMS3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
H2-M5A7VMS3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H2-M5A7VMS3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
H2-M5A7VMS3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H2-M5A7VMS3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2-M5A7VMS3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2-M5A7VMS3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2-M5A7VMS3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2-M5A7VMS3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2-M5A7VMS3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2-M5A7VMS3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
H2-M5A7VMS3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2-M5A7VMS3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2-M5A7VMS3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
H2-M5A7VMS3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2-M5A7VMS3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2-M5A7VMS3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2-M5A7VMS3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2-M5A7VMS3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2-M5A7VMS3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2-M5A7VMS3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2-M5A7VMS3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2-M5A7VMS3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2-M5A7VMS3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2-M5A7VMS3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
H2-M5A7VMS3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2-M5A7VMS3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2-M5A7VMS3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2-M5A7VMS3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2-M5A7VMS3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2-M5A7VMS3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2-M5A7VMS3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2-M5A7VMS3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2-M5A7VMS3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2-M5A7VMS3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2-M5A7VMS3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2-M5A7VMS3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2-M5A7VMS3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2-M5A7VMS3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2-M5A7VMS3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2-M5A7VMS3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2-M5A7VMS3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2-M5A7VMS3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2-M5A7VMS3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2-M5A7VMS3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
H2-M5A7VMS3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-M5A7VMS3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-M5A7VMS3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2-M5A7VMS3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2-M5A7VMS3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2-M5A7VMS3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2-M5A7VMS3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-M5A7VMS3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-M5A7VMS3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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