Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc9bA3KGF9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc9bA3KGF9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc9bA3KGF9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc9bA3KGF9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc9bA3KGF9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc9bA3KGF9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc9bA3KGF9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc9bA3KGF9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc9bA3KGF9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc9bA3KGF9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc9bA3KGF9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc9bA3KGF9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc9bA3KGF9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc9bA3KGF9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc9bA3KGF9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc9bA3KGF9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc9bA3KGF9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc9bA3KGF9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc9bA3KGF9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc9bA3KGF9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc9bA3KGF9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc9bA3KGF9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc9bA3KGF9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc9bA3KGF9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc9bA3KGF9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc9bA3KGF9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc9bA3KGF9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc9bA3KGF9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc9bA3KGF9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc9bA3KGF9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc9bA3KGF9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc9bA3KGF9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc9bA3KGF9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc9bA3KGF9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc9bA3KGF9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc9bA3KGF9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc9bA3KGF9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc9bA3KGF9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc9bA3KGF9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc9bA3KGF9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc9bA3KGF9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc9bA3KGF9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc9bA3KGF9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc9bA3KGF9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc9bA3KGF9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc9bA3KGF9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc9bA3KGF9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc9bA3KGF9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc9bA3KGF9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc9bA3KGF9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc9bA3KGF9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc9bA3KGF9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc9bA3KGF9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc9bA3KGF9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc9bA3KGF9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc9bA3KGF9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc9bA3KGF9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc9bA3KGF9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc9bA3KGF9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc9bA3KGF9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccdc9bA3KGF9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc9bA3KGF9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc9bA3KGF9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc9bA3KGF9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc9bA3KGF9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc9bA3KGF9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc9bA3KGF9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc9bA3KGF9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc9bA3KGF9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc9bA3KGF9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc9bA3KGF9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc9bA3KGF9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc9bA3KGF9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc9bA3KGF9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc9bA3KGF9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc9bA3KGF9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc9bA3KGF9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc9bA3KGF9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc9bA3KGF9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc9bA3KGF9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc9bA3KGF9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc9bA3KGF9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc9bA3KGF9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc9bA3KGF9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc9bA3KGF9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc9bA3KGF9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc9bA3KGF9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc9bA3KGF9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc9bA3KGF9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc9bA3KGF9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc9bA3KGF9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc9bA3KGF9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc9bA3KGF9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc9bA3KGF9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc9bA3KGF9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc9bA3KGF9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc9bA3KGF9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc9bA3KGF9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc9bA3KGF9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms