Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gm6880A3KG45 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gm6880A3KG45 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm6880A3KG45 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gm6880A3KG45 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm6880A3KG45 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm6880A3KG45 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gm6880A3KG45 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gm6880A3KG45 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gm6880A3KG45 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Gm6880A3KG45 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gm6880A3KG45 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gm6880A3KG45 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gm6880A3KG45 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gm6880A3KG45 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Gm6880A3KG45 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm6880A3KG45 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gm6880A3KG45 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gm6880A3KG45 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gm6880A3KG45 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gm6880A3KG45 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm6880A3KG45 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gm6880A3KG45 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gm6880A3KG45 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gm6880A3KG45 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gm6880A3KG45 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gm6880A3KG45 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gm6880A3KG45 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gm6880A3KG45 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gm6880A3KG45 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gm6880A3KG45 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gm6880A3KG45 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gm6880A3KG45 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gm6880A3KG45 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Gm6880A3KG45 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm6880A3KG45 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gm6880A3KG45 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gm6880A3KG45 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gm6880A3KG45 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm6880A3KG45 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gm6880A3KG45 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gm6880A3KG45 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Gm6880A3KG45 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm6880A3KG45 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm6880A3KG45 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm6880A3KG45 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm6880A3KG45 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm6880A3KG45 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gm6880A3KG45 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm6880A3KG45 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm6880A3KG45 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm6880A3KG45 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm6880A3KG45 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm6880A3KG45 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gm6880A3KG45 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm6880A3KG45 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm6880A3KG45 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm6880A3KG45 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm6880A3KG45 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm6880A3KG45 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm6880A3KG45 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm6880A3KG45 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm6880A3KG45 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Gm6880A3KG45 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm6880A3KG45 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm6880A3KG45 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm6880A3KG45 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm6880A3KG45 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm6880A3KG45 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm6880A3KG45 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm6880A3KG45 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm6880A3KG45 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm6880A3KG45 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm6880A3KG45 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm6880A3KG45 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm6880A3KG45 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm6880A3KG45 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm6880A3KG45 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm6880A3KG45 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm6880A3KG45 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm6880A3KG45 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm6880A3KG45 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm6880A3KG45 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm6880A3KG45 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gm6880A3KG45 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm6880A3KG45 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm6880A3KG45 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm6880A3KG45 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm6880A3KG45 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm6880A3KG45 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm6880A3KG45 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm6880A3KG45 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm6880A3KG45 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm6880A3KG45 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm6880A3KG45 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Gm6880A3KG45 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Gm6880A3KG45 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm6880A3KG45 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm6880A3KG45 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm6880A3KG45 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
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