Protein–RNA interactions for Protein: A2ANA3

Cldn34c4, Claudin 34C4, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c4A2ANA3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn34c4A2ANA3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn34c4A2ANA3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn34c4A2ANA3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn34c4A2ANA3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn34c4A2ANA3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn34c4A2ANA3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cldn34c4A2ANA3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn34c4A2ANA3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn34c4A2ANA3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn34c4A2ANA3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn34c4A2ANA3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn34c4A2ANA3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn34c4A2ANA3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn34c4A2ANA3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cldn34c4A2ANA3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn34c4A2ANA3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn34c4A2ANA3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn34c4A2ANA3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn34c4A2ANA3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn34c4A2ANA3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn34c4A2ANA3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn34c4A2ANA3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn34c4A2ANA3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn34c4A2ANA3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn34c4A2ANA3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn34c4A2ANA3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn34c4A2ANA3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn34c4A2ANA3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cldn34c4A2ANA3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn34c4A2ANA3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn34c4A2ANA3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cldn34c4A2ANA3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn34c4A2ANA3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn34c4A2ANA3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn34c4A2ANA3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn34c4A2ANA3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn34c4A2ANA3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn34c4A2ANA3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cldn34c4A2ANA3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn34c4A2ANA3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn34c4A2ANA3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cldn34c4A2ANA3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cldn34c4A2ANA3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cldn34c4A2ANA3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn34c4A2ANA3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn34c4A2ANA3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cldn34c4A2ANA3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn34c4A2ANA3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn34c4A2ANA3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn34c4A2ANA3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cldn34c4A2ANA3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cldn34c4A2ANA3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn34c4A2ANA3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cldn34c4A2ANA3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn34c4A2ANA3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cldn34c4A2ANA3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cldn34c4A2ANA3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cldn34c4A2ANA3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn34c4A2ANA3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn34c4A2ANA3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cldn34c4A2ANA3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cldn34c4A2ANA3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cldn34c4A2ANA3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cldn34c4A2ANA3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cldn34c4A2ANA3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cldn34c4A2ANA3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Cldn34c4A2ANA3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cldn34c4A2ANA3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cldn34c4A2ANA3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Cldn34c4A2ANA3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cldn34c4A2ANA3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Cldn34c4A2ANA3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cldn34c4A2ANA3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cldn34c4A2ANA3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cldn34c4A2ANA3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cldn34c4A2ANA3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cldn34c4A2ANA3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cldn34c4A2ANA3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cldn34c4A2ANA3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Cldn34c4A2ANA3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cldn34c4A2ANA3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cldn34c4A2ANA3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cldn34c4A2ANA3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cldn34c4A2ANA3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cldn34c4A2ANA3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cldn34c4A2ANA3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cldn34c4A2ANA3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cldn34c4A2ANA3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cldn34c4A2ANA3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cldn34c4A2ANA3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cldn34c4A2ANA3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cldn34c4A2ANA3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cldn34c4A2ANA3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cldn34c4A2ANA3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cldn34c4A2ANA3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cldn34c4A2ANA3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cldn34c4A2ANA3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cldn34c4A2ANA3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cldn34c4A2ANA3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.8 ms