Protein–RNA interactions for Protein: A2A5X4

Krtap29-1, Keratin-associated protein 29-1, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap29-1A2A5X4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krtap29-1A2A5X4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krtap29-1A2A5X4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krtap29-1A2A5X4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krtap29-1A2A5X4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krtap29-1A2A5X4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krtap29-1A2A5X4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krtap29-1A2A5X4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krtap29-1A2A5X4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krtap29-1A2A5X4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krtap29-1A2A5X4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Krtap29-1A2A5X4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krtap29-1A2A5X4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krtap29-1A2A5X4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krtap29-1A2A5X4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krtap29-1A2A5X4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Krtap29-1A2A5X4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krtap29-1A2A5X4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krtap29-1A2A5X4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krtap29-1A2A5X4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krtap29-1A2A5X4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krtap29-1A2A5X4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Krtap29-1A2A5X4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Krtap29-1A2A5X4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krtap29-1A2A5X4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krtap29-1A2A5X4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krtap29-1A2A5X4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krtap29-1A2A5X4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krtap29-1A2A5X4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krtap29-1A2A5X4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krtap29-1A2A5X4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krtap29-1A2A5X4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krtap29-1A2A5X4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krtap29-1A2A5X4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krtap29-1A2A5X4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krtap29-1A2A5X4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krtap29-1A2A5X4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krtap29-1A2A5X4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Krtap29-1A2A5X4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krtap29-1A2A5X4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Krtap29-1A2A5X4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krtap29-1A2A5X4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krtap29-1A2A5X4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Krtap29-1A2A5X4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Krtap29-1A2A5X4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krtap29-1A2A5X4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krtap29-1A2A5X4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krtap29-1A2A5X4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Krtap29-1A2A5X4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krtap29-1A2A5X4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krtap29-1A2A5X4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krtap29-1A2A5X4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krtap29-1A2A5X4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krtap29-1A2A5X4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krtap29-1A2A5X4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krtap29-1A2A5X4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krtap29-1A2A5X4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krtap29-1A2A5X4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Krtap29-1A2A5X4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krtap29-1A2A5X4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krtap29-1A2A5X4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krtap29-1A2A5X4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krtap29-1A2A5X4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krtap29-1A2A5X4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krtap29-1A2A5X4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krtap29-1A2A5X4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krtap29-1A2A5X4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krtap29-1A2A5X4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krtap29-1A2A5X4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krtap29-1A2A5X4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krtap29-1A2A5X4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krtap29-1A2A5X4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krtap29-1A2A5X4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Krtap29-1A2A5X4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krtap29-1A2A5X4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Krtap29-1A2A5X4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krtap29-1A2A5X4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krtap29-1A2A5X4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krtap29-1A2A5X4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krtap29-1A2A5X4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krtap29-1A2A5X4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krtap29-1A2A5X4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krtap29-1A2A5X4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krtap29-1A2A5X4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krtap29-1A2A5X4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krtap29-1A2A5X4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krtap29-1A2A5X4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krtap29-1A2A5X4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krtap29-1A2A5X4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krtap29-1A2A5X4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krtap29-1A2A5X4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krtap29-1A2A5X4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krtap29-1A2A5X4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krtap29-1A2A5X4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krtap29-1A2A5X4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krtap29-1A2A5X4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krtap29-1A2A5X4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krtap29-1A2A5X4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krtap29-1A2A5X4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krtap29-1A2A5X4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms