Protein–RNA interactions for Protein: A2A4M0

2300003K06Rik, MCG1025736, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2300003K06RikA2A4M0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
2300003K06RikA2A4M0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
2300003K06RikA2A4M0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
2300003K06RikA2A4M0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
2300003K06RikA2A4M0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
2300003K06RikA2A4M0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
2300003K06RikA2A4M0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
2300003K06RikA2A4M0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
2300003K06RikA2A4M0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
2300003K06RikA2A4M0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
2300003K06RikA2A4M0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
2300003K06RikA2A4M0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
2300003K06RikA2A4M0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
2300003K06RikA2A4M0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
2300003K06RikA2A4M0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
2300003K06RikA2A4M0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
2300003K06RikA2A4M0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
2300003K06RikA2A4M0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
2300003K06RikA2A4M0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
2300003K06RikA2A4M0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
2300003K06RikA2A4M0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
2300003K06RikA2A4M0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
2300003K06RikA2A4M0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
2300003K06RikA2A4M0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
2300003K06RikA2A4M0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
2300003K06RikA2A4M0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
2300003K06RikA2A4M0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
2300003K06RikA2A4M0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
2300003K06RikA2A4M0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
2300003K06RikA2A4M0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
2300003K06RikA2A4M0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
2300003K06RikA2A4M0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
2300003K06RikA2A4M0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
2300003K06RikA2A4M0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
2300003K06RikA2A4M0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
2300003K06RikA2A4M0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
2300003K06RikA2A4M0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
2300003K06RikA2A4M0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
2300003K06RikA2A4M0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
2300003K06RikA2A4M0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
2300003K06RikA2A4M0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
2300003K06RikA2A4M0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
2300003K06RikA2A4M0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
2300003K06RikA2A4M0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
2300003K06RikA2A4M0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
2300003K06RikA2A4M0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
2300003K06RikA2A4M0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
2300003K06RikA2A4M0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
2300003K06RikA2A4M0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
2300003K06RikA2A4M0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
2300003K06RikA2A4M0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
2300003K06RikA2A4M0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
2300003K06RikA2A4M0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
2300003K06RikA2A4M0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
2300003K06RikA2A4M0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
2300003K06RikA2A4M0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
2300003K06RikA2A4M0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
2300003K06RikA2A4M0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
2300003K06RikA2A4M0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
2300003K06RikA2A4M0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
2300003K06RikA2A4M0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
2300003K06RikA2A4M0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
2300003K06RikA2A4M0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
2300003K06RikA2A4M0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
2300003K06RikA2A4M0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
2300003K06RikA2A4M0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
2300003K06RikA2A4M0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
2300003K06RikA2A4M0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
2300003K06RikA2A4M0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
2300003K06RikA2A4M0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
2300003K06RikA2A4M0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
2300003K06RikA2A4M0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
2300003K06RikA2A4M0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
2300003K06RikA2A4M0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
2300003K06RikA2A4M0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
2300003K06RikA2A4M0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
2300003K06RikA2A4M0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
2300003K06RikA2A4M0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
2300003K06RikA2A4M0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
2300003K06RikA2A4M0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
2300003K06RikA2A4M0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
2300003K06RikA2A4M0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
2300003K06RikA2A4M0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
2300003K06RikA2A4M0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
2300003K06RikA2A4M0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
2300003K06RikA2A4M0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
2300003K06RikA2A4M0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
2300003K06RikA2A4M0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
2300003K06RikA2A4M0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
2300003K06RikA2A4M0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
2300003K06RikA2A4M0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
2300003K06RikA2A4M0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
2300003K06RikA2A4M0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
2300003K06RikA2A4M0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
2300003K06RikA2A4M0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
2300003K06RikA2A4M0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
2300003K06RikA2A4M0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
2300003K06RikA2A4M0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
2300003K06RikA2A4M0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
2300003K06RikA2A4M0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms