Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C1

Fam71e1, Protein FAM71E1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71e1A1L3C1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Fam71e1A1L3C1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
Fam71e1A1L3C1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Fam71e1A1L3C1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Fam71e1A1L3C1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Fam71e1A1L3C1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Fam71e1A1L3C1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Fam71e1A1L3C1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Fam71e1A1L3C1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Fam71e1A1L3C1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Fam71e1A1L3C1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Fam71e1A1L3C1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Fam71e1A1L3C1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
Fam71e1A1L3C1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
Fam71e1A1L3C1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Fam71e1A1L3C1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Fam71e1A1L3C1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Fam71e1A1L3C1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Fam71e1A1L3C1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Fam71e1A1L3C1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Fam71e1A1L3C1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Fam71e1A1L3C1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
Fam71e1A1L3C1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Fam71e1A1L3C1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Fam71e1A1L3C1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Fam71e1A1L3C1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Fam71e1A1L3C1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Fam71e1A1L3C1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Fam71e1A1L3C1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
Fam71e1A1L3C1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Fam71e1A1L3C1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
Fam71e1A1L3C1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Fam71e1A1L3C1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Fam71e1A1L3C1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Fam71e1A1L3C1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Fam71e1A1L3C1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Fam71e1A1L3C1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Fam71e1A1L3C1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Fam71e1A1L3C1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Fam71e1A1L3C1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Fam71e1A1L3C1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Fam71e1A1L3C1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Fam71e1A1L3C1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Fam71e1A1L3C1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Fam71e1A1L3C1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Fam71e1A1L3C1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Fam71e1A1L3C1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Fam71e1A1L3C1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Fam71e1A1L3C1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Fam71e1A1L3C1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Fam71e1A1L3C1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Fam71e1A1L3C1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Fam71e1A1L3C1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Fam71e1A1L3C1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Fam71e1A1L3C1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
Fam71e1A1L3C1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Fam71e1A1L3C1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Fam71e1A1L3C1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Fam71e1A1L3C1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Fam71e1A1L3C1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Fam71e1A1L3C1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Fam71e1A1L3C1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Fam71e1A1L3C1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Fam71e1A1L3C1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Fam71e1A1L3C1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Fam71e1A1L3C1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Fam71e1A1L3C1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Fam71e1A1L3C1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Fam71e1A1L3C1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Fam71e1A1L3C1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Fam71e1A1L3C1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Fam71e1A1L3C1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Fam71e1A1L3C1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
Fam71e1A1L3C1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Fam71e1A1L3C1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Fam71e1A1L3C1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Fam71e1A1L3C1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Fam71e1A1L3C1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Fam71e1A1L3C1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Fam71e1A1L3C1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Fam71e1A1L3C1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Fam71e1A1L3C1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Fam71e1A1L3C1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Fam71e1A1L3C1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Fam71e1A1L3C1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Fam71e1A1L3C1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Fam71e1A1L3C1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Fam71e1A1L3C1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Fam71e1A1L3C1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Fam71e1A1L3C1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Fam71e1A1L3C1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Fam71e1A1L3C1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Fam71e1A1L3C1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Fam71e1A1L3C1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Fam71e1A1L3C1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Fam71e1A1L3C1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Fam71e1A1L3C1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Fam71e1A1L3C1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Fam71e1A1L3C1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Fam71e1A1L3C1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms