Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WR36

Vmn1r90, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r90A0A087WR36 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Vmn1r90A0A087WR36 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Vmn1r90A0A087WR36 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vmn1r90A0A087WR36 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vmn1r90A0A087WR36 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Vmn1r90A0A087WR36 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Vmn1r90A0A087WR36 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Vmn1r90A0A087WR36 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Vmn1r90A0A087WR36 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Vmn1r90A0A087WR36 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Vmn1r90A0A087WR36 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Vmn1r90A0A087WR36 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Vmn1r90A0A087WR36 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Vmn1r90A0A087WR36 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Vmn1r90A0A087WR36 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Vmn1r90A0A087WR36 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Vmn1r90A0A087WR36 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Vmn1r90A0A087WR36 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Vmn1r90A0A087WR36 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Vmn1r90A0A087WR36 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Vmn1r90A0A087WR36 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Vmn1r90A0A087WR36 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vmn1r90A0A087WR36 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vmn1r90A0A087WR36 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vmn1r90A0A087WR36 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vmn1r90A0A087WR36 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vmn1r90A0A087WR36 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vmn1r90A0A087WR36 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vmn1r90A0A087WR36 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Vmn1r90A0A087WR36 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Vmn1r90A0A087WR36 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Vmn1r90A0A087WR36 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vmn1r90A0A087WR36 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Vmn1r90A0A087WR36 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Vmn1r90A0A087WR36 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Vmn1r90A0A087WR36 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Vmn1r90A0A087WR36 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vmn1r90A0A087WR36 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vmn1r90A0A087WR36 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Vmn1r90A0A087WR36 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vmn1r90A0A087WR36 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vmn1r90A0A087WR36 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Vmn1r90A0A087WR36 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vmn1r90A0A087WR36 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vmn1r90A0A087WR36 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vmn1r90A0A087WR36 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vmn1r90A0A087WR36 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vmn1r90A0A087WR36 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vmn1r90A0A087WR36 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Vmn1r90A0A087WR36 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vmn1r90A0A087WR36 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vmn1r90A0A087WR36 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vmn1r90A0A087WR36 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vmn1r90A0A087WR36 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vmn1r90A0A087WR36 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vmn1r90A0A087WR36 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vmn1r90A0A087WR36 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Vmn1r90A0A087WR36 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Vmn1r90A0A087WR36 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Vmn1r90A0A087WR36 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vmn1r90A0A087WR36 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vmn1r90A0A087WR36 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vmn1r90A0A087WR36 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vmn1r90A0A087WR36 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vmn1r90A0A087WR36 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vmn1r90A0A087WR36 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vmn1r90A0A087WR36 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vmn1r90A0A087WR36 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vmn1r90A0A087WR36 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vmn1r90A0A087WR36 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vmn1r90A0A087WR36 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vmn1r90A0A087WR36 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vmn1r90A0A087WR36 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Vmn1r90A0A087WR36 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vmn1r90A0A087WR36 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Vmn1r90A0A087WR36 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vmn1r90A0A087WR36 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vmn1r90A0A087WR36 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vmn1r90A0A087WR36 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vmn1r90A0A087WR36 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Vmn1r90A0A087WR36 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vmn1r90A0A087WR36 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vmn1r90A0A087WR36 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vmn1r90A0A087WR36 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vmn1r90A0A087WR36 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vmn1r90A0A087WR36 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vmn1r90A0A087WR36 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vmn1r90A0A087WR36 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vmn1r90A0A087WR36 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vmn1r90A0A087WR36 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vmn1r90A0A087WR36 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vmn1r90A0A087WR36 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vmn1r90A0A087WR36 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vmn1r90A0A087WR36 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vmn1r90A0A087WR36 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vmn1r90A0A087WR36 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vmn1r90A0A087WR36 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vmn1r90A0A087WR36 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vmn1r90A0A087WR36 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vmn1r90A0A087WR36 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms