Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYY8

Spast, Spastin, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpastQ9QYY8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SpastQ9QYY8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SpastQ9QYY8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SpastQ9QYY8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SpastQ9QYY8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SpastQ9QYY8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SpastQ9QYY8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SpastQ9QYY8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SpastQ9QYY8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SpastQ9QYY8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SpastQ9QYY8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SpastQ9QYY8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SpastQ9QYY8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SpastQ9QYY8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SpastQ9QYY8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SpastQ9QYY8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SpastQ9QYY8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SpastQ9QYY8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SpastQ9QYY8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SpastQ9QYY8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SpastQ9QYY8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SpastQ9QYY8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SpastQ9QYY8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SpastQ9QYY8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SpastQ9QYY8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SpastQ9QYY8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SpastQ9QYY8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SpastQ9QYY8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SpastQ9QYY8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SpastQ9QYY8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SpastQ9QYY8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SpastQ9QYY8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SpastQ9QYY8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SpastQ9QYY8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SpastQ9QYY8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SpastQ9QYY8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SpastQ9QYY8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SpastQ9QYY8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SpastQ9QYY8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SpastQ9QYY8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SpastQ9QYY8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SpastQ9QYY8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SpastQ9QYY8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SpastQ9QYY8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SpastQ9QYY8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SpastQ9QYY8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SpastQ9QYY8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SpastQ9QYY8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SpastQ9QYY8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SpastQ9QYY8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SpastQ9QYY8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SpastQ9QYY8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SpastQ9QYY8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SpastQ9QYY8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SpastQ9QYY8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SpastQ9QYY8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SpastQ9QYY8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SpastQ9QYY8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SpastQ9QYY8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SpastQ9QYY8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SpastQ9QYY8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SpastQ9QYY8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SpastQ9QYY8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SpastQ9QYY8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SpastQ9QYY8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SpastQ9QYY8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SpastQ9QYY8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SpastQ9QYY8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SpastQ9QYY8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SpastQ9QYY8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SpastQ9QYY8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SpastQ9QYY8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SpastQ9QYY8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SpastQ9QYY8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SpastQ9QYY8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SpastQ9QYY8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SpastQ9QYY8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SpastQ9QYY8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SpastQ9QYY8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SpastQ9QYY8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SpastQ9QYY8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SpastQ9QYY8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SpastQ9QYY8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SpastQ9QYY8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SpastQ9QYY8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SpastQ9QYY8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SpastQ9QYY8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SpastQ9QYY8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SpastQ9QYY8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SpastQ9QYY8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SpastQ9QYY8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SpastQ9QYY8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SpastQ9QYY8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SpastQ9QYY8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SpastQ9QYY8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SpastQ9QYY8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SpastQ9QYY8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SpastQ9QYY8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SpastQ9QYY8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SpastQ9QYY8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms