Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc2lQ9JME7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc2lQ9JME7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc2lQ9JME7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc2lQ9JME7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc2lQ9JME7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc2lQ9JME7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc2lQ9JME7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc2lQ9JME7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc2lQ9JME7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc2lQ9JME7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc2lQ9JME7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc2lQ9JME7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc2lQ9JME7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc2lQ9JME7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc2lQ9JME7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc2lQ9JME7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc2lQ9JME7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc2lQ9JME7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc2lQ9JME7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc2lQ9JME7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc2lQ9JME7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc2lQ9JME7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc2lQ9JME7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc2lQ9JME7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc2lQ9JME7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc2lQ9JME7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc2lQ9JME7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc2lQ9JME7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc2lQ9JME7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc2lQ9JME7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc2lQ9JME7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc2lQ9JME7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc2lQ9JME7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc2lQ9JME7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc2lQ9JME7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc2lQ9JME7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc2lQ9JME7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms