Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtsmQ9JL96 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtsmQ9JL96 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtsmQ9JL96 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CtsmQ9JL96 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtsmQ9JL96 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CtsmQ9JL96 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtsmQ9JL96 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtsmQ9JL96 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtsmQ9JL96 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtsmQ9JL96 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtsmQ9JL96 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtsmQ9JL96 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtsmQ9JL96 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtsmQ9JL96 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtsmQ9JL96 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtsmQ9JL96 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtsmQ9JL96 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtsmQ9JL96 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtsmQ9JL96 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtsmQ9JL96 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtsmQ9JL96 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtsmQ9JL96 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtsmQ9JL96 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtsmQ9JL96 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtsmQ9JL96 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CtsmQ9JL96 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtsmQ9JL96 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtsmQ9JL96 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtsmQ9JL96 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtsmQ9JL96 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtsmQ9JL96 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtsmQ9JL96 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtsmQ9JL96 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtsmQ9JL96 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtsmQ9JL96 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtsmQ9JL96 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtsmQ9JL96 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtsmQ9JL96 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CtsmQ9JL96 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtsmQ9JL96 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtsmQ9JL96 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CtsmQ9JL96 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CtsmQ9JL96 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CtsmQ9JL96 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CtsmQ9JL96 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CtsmQ9JL96 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CtsmQ9JL96 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CtsmQ9JL96 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CtsmQ9JL96 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtsmQ9JL96 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtsmQ9JL96 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtsmQ9JL96 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CtsmQ9JL96 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CtsmQ9JL96 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CtsmQ9JL96 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CtsmQ9JL96 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtsmQ9JL96 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtsmQ9JL96 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtsmQ9JL96 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtsmQ9JL96 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtsmQ9JL96 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtsmQ9JL96 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtsmQ9JL96 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtsmQ9JL96 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtsmQ9JL96 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtsmQ9JL96 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtsmQ9JL96 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtsmQ9JL96 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtsmQ9JL96 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtsmQ9JL96 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtsmQ9JL96 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtsmQ9JL96 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtsmQ9JL96 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtsmQ9JL96 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtsmQ9JL96 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CtsmQ9JL96 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CtsmQ9JL96 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CtsmQ9JL96 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CtsmQ9JL96 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CtsmQ9JL96 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CtsmQ9JL96 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CtsmQ9JL96 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CtsmQ9JL96 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CtsmQ9JL96 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CtsmQ9JL96 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CtsmQ9JL96 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CtsmQ9JL96 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CtsmQ9JL96 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CtsmQ9JL96 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CtsmQ9JL96 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CtsmQ9JL96 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CtsmQ9JL96 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CtsmQ9JL96 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CtsmQ9JL96 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CtsmQ9JL96 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CtsmQ9JL96 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CtsmQ9JL96 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CtsmQ9JL96 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtsmQ9JL96 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms