Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc12a4Q9JIS8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc12a4Q9JIS8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc12a4Q9JIS8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc12a4Q9JIS8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc12a4Q9JIS8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc12a4Q9JIS8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc12a4Q9JIS8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc12a4Q9JIS8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc12a4Q9JIS8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc12a4Q9JIS8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc12a4Q9JIS8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc12a4Q9JIS8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc12a4Q9JIS8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc12a4Q9JIS8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc12a4Q9JIS8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc12a4Q9JIS8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc12a4Q9JIS8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc12a4Q9JIS8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc12a4Q9JIS8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc12a4Q9JIS8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc12a4Q9JIS8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc12a4Q9JIS8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc12a4Q9JIS8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc12a4Q9JIS8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc12a4Q9JIS8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc12a4Q9JIS8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc12a4Q9JIS8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc12a4Q9JIS8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc12a4Q9JIS8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc12a4Q9JIS8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc12a4Q9JIS8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc12a4Q9JIS8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc12a4Q9JIS8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc12a4Q9JIS8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc12a4Q9JIS8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc12a4Q9JIS8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc12a4Q9JIS8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc12a4Q9JIS8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc12a4Q9JIS8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc12a4Q9JIS8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc12a4Q9JIS8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc12a4Q9JIS8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc12a4Q9JIS8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc12a4Q9JIS8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc12a4Q9JIS8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc12a4Q9JIS8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc12a4Q9JIS8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc12a4Q9JIS8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc12a4Q9JIS8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc12a4Q9JIS8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc12a4Q9JIS8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc12a4Q9JIS8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc12a4Q9JIS8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc12a4Q9JIS8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc12a4Q9JIS8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc12a4Q9JIS8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc12a4Q9JIS8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc12a4Q9JIS8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc12a4Q9JIS8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc12a4Q9JIS8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc12a4Q9JIS8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc12a4Q9JIS8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc12a4Q9JIS8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc12a4Q9JIS8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc12a4Q9JIS8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc12a4Q9JIS8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc12a4Q9JIS8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc12a4Q9JIS8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc12a4Q9JIS8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc12a4Q9JIS8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc12a4Q9JIS8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc12a4Q9JIS8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc12a4Q9JIS8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc12a4Q9JIS8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc12a4Q9JIS8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc12a4Q9JIS8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc12a4Q9JIS8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc12a4Q9JIS8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc12a4Q9JIS8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc12a4Q9JIS8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc12a4Q9JIS8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc12a4Q9JIS8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc12a4Q9JIS8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc12a4Q9JIS8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc12a4Q9JIS8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc12a4Q9JIS8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc12a4Q9JIS8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc12a4Q9JIS8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc12a4Q9JIS8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc12a4Q9JIS8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc12a4Q9JIS8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc12a4Q9JIS8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc12a4Q9JIS8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc12a4Q9JIS8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc12a4Q9JIS8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc12a4Q9JIS8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc12a4Q9JIS8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc12a4Q9JIS8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc12a4Q9JIS8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.5 ms