Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ush1cQ9ES64 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ush1cQ9ES64 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ush1cQ9ES64 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ush1cQ9ES64 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ush1cQ9ES64 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ush1cQ9ES64 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ush1cQ9ES64 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ush1cQ9ES64 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ush1cQ9ES64 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ush1cQ9ES64 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ush1cQ9ES64 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ush1cQ9ES64 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ush1cQ9ES64 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ush1cQ9ES64 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ush1cQ9ES64 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ush1cQ9ES64 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ush1cQ9ES64 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ush1cQ9ES64 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ush1cQ9ES64 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ush1cQ9ES64 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ush1cQ9ES64 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ush1cQ9ES64 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ush1cQ9ES64 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ush1cQ9ES64 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ush1cQ9ES64 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ush1cQ9ES64 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ush1cQ9ES64 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ush1cQ9ES64 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ush1cQ9ES64 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ush1cQ9ES64 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ush1cQ9ES64 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ush1cQ9ES64 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ush1cQ9ES64 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ush1cQ9ES64 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ush1cQ9ES64 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ush1cQ9ES64 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ush1cQ9ES64 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ush1cQ9ES64 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ush1cQ9ES64 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ush1cQ9ES64 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ush1cQ9ES64 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ush1cQ9ES64 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ush1cQ9ES64 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ush1cQ9ES64 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ush1cQ9ES64 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ush1cQ9ES64 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ush1cQ9ES64 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ush1cQ9ES64 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ush1cQ9ES64 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ush1cQ9ES64 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ush1cQ9ES64 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ush1cQ9ES64 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ush1cQ9ES64 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ush1cQ9ES64 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ush1cQ9ES64 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ush1cQ9ES64 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ush1cQ9ES64 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ush1cQ9ES64 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ush1cQ9ES64 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ush1cQ9ES64 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ush1cQ9ES64 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ush1cQ9ES64 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ush1cQ9ES64 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ush1cQ9ES64 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ush1cQ9ES64 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ush1cQ9ES64 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ush1cQ9ES64 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ush1cQ9ES64 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ush1cQ9ES64 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ush1cQ9ES64 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ush1cQ9ES64 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ush1cQ9ES64 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ush1cQ9ES64 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ush1cQ9ES64 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ush1cQ9ES64 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ush1cQ9ES64 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ush1cQ9ES64 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ush1cQ9ES64 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ush1cQ9ES64 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ush1cQ9ES64 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ush1cQ9ES64 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ush1cQ9ES64 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ush1cQ9ES64 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ush1cQ9ES64 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ush1cQ9ES64 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ush1cQ9ES64 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ush1cQ9ES64 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ush1cQ9ES64 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ush1cQ9ES64 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ush1cQ9ES64 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ush1cQ9ES64 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ush1cQ9ES64 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ush1cQ9ES64 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ush1cQ9ES64 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ush1cQ9ES64 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ush1cQ9ES64 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ush1cQ9ES64 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ush1cQ9ES64 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ush1cQ9ES64 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms