Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tfcp2Q9ERA0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tfcp2Q9ERA0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tfcp2Q9ERA0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tfcp2Q9ERA0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tfcp2Q9ERA0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tfcp2Q9ERA0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tfcp2Q9ERA0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Tfcp2Q9ERA0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tfcp2Q9ERA0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tfcp2Q9ERA0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tfcp2Q9ERA0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tfcp2Q9ERA0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tfcp2Q9ERA0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Tfcp2Q9ERA0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tfcp2Q9ERA0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tfcp2Q9ERA0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tfcp2Q9ERA0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tfcp2Q9ERA0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tfcp2Q9ERA0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tfcp2Q9ERA0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tfcp2Q9ERA0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tfcp2Q9ERA0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tfcp2Q9ERA0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tfcp2Q9ERA0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tfcp2Q9ERA0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tfcp2Q9ERA0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tfcp2Q9ERA0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tfcp2Q9ERA0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tfcp2Q9ERA0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tfcp2Q9ERA0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tfcp2Q9ERA0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tfcp2Q9ERA0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tfcp2Q9ERA0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tfcp2Q9ERA0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tfcp2Q9ERA0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tfcp2Q9ERA0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tfcp2Q9ERA0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tfcp2Q9ERA0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tfcp2Q9ERA0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tfcp2Q9ERA0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tfcp2Q9ERA0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tfcp2Q9ERA0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tfcp2Q9ERA0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tfcp2Q9ERA0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tfcp2Q9ERA0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tfcp2Q9ERA0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tfcp2Q9ERA0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tfcp2Q9ERA0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tfcp2Q9ERA0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tfcp2Q9ERA0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tfcp2Q9ERA0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tfcp2Q9ERA0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tfcp2Q9ERA0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tfcp2Q9ERA0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tfcp2Q9ERA0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tfcp2Q9ERA0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tfcp2Q9ERA0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tfcp2Q9ERA0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tfcp2Q9ERA0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tfcp2Q9ERA0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tfcp2Q9ERA0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tfcp2Q9ERA0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tfcp2Q9ERA0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tfcp2Q9ERA0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tfcp2Q9ERA0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Tfcp2Q9ERA0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tfcp2Q9ERA0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tfcp2Q9ERA0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Tfcp2Q9ERA0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tfcp2Q9ERA0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tfcp2Q9ERA0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tfcp2Q9ERA0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tfcp2Q9ERA0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tfcp2Q9ERA0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tfcp2Q9ERA0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tfcp2Q9ERA0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tfcp2Q9ERA0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tfcp2Q9ERA0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tfcp2Q9ERA0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tfcp2Q9ERA0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tfcp2Q9ERA0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tfcp2Q9ERA0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tfcp2Q9ERA0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tfcp2Q9ERA0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tfcp2Q9ERA0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tfcp2Q9ERA0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tfcp2Q9ERA0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tfcp2Q9ERA0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tfcp2Q9ERA0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tfcp2Q9ERA0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tfcp2Q9ERA0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tfcp2Q9ERA0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tfcp2Q9ERA0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tfcp2Q9ERA0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Tfcp2Q9ERA0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tfcp2Q9ERA0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tfcp2Q9ERA0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tfcp2Q9ERA0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tfcp2Q9ERA0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms