Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf6Q9DBU5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf6Q9DBU5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf6Q9DBU5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf6Q9DBU5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf6Q9DBU5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf6Q9DBU5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf6Q9DBU5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf6Q9DBU5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf6Q9DBU5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf6Q9DBU5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf6Q9DBU5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf6Q9DBU5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf6Q9DBU5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf6Q9DBU5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf6Q9DBU5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf6Q9DBU5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf6Q9DBU5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf6Q9DBU5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf6Q9DBU5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf6Q9DBU5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf6Q9DBU5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf6Q9DBU5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf6Q9DBU5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf6Q9DBU5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf6Q9DBU5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf6Q9DBU5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf6Q9DBU5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf6Q9DBU5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf6Q9DBU5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf6Q9DBU5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf6Q9DBU5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf6Q9DBU5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf6Q9DBU5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf6Q9DBU5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf6Q9DBU5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf6Q9DBU5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rnf6Q9DBU5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rnf6Q9DBU5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rnf6Q9DBU5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf6Q9DBU5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf6Q9DBU5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf6Q9DBU5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf6Q9DBU5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf6Q9DBU5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf6Q9DBU5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf6Q9DBU5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf6Q9DBU5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf6Q9DBU5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf6Q9DBU5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf6Q9DBU5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf6Q9DBU5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf6Q9DBU5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf6Q9DBU5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf6Q9DBU5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf6Q9DBU5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf6Q9DBU5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf6Q9DBU5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf6Q9DBU5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf6Q9DBU5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf6Q9DBU5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf6Q9DBU5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf6Q9DBU5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf6Q9DBU5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf6Q9DBU5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf6Q9DBU5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf6Q9DBU5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf6Q9DBU5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf6Q9DBU5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf6Q9DBU5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf6Q9DBU5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf6Q9DBU5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf6Q9DBU5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf6Q9DBU5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf6Q9DBU5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf6Q9DBU5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf6Q9DBU5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf6Q9DBU5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf6Q9DBU5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf6Q9DBU5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf6Q9DBU5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf6Q9DBU5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf6Q9DBU5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf6Q9DBU5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf6Q9DBU5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rnf6Q9DBU5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rnf6Q9DBU5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf6Q9DBU5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf6Q9DBU5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf6Q9DBU5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf6Q9DBU5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf6Q9DBU5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf6Q9DBU5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf6Q9DBU5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf6Q9DBU5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf6Q9DBU5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf6Q9DBU5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms