Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem239Q9DA47 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem239Q9DA47 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem239Q9DA47 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem239Q9DA47 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem239Q9DA47 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem239Q9DA47 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem239Q9DA47 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem239Q9DA47 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem239Q9DA47 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem239Q9DA47 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem239Q9DA47 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem239Q9DA47 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem239Q9DA47 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem239Q9DA47 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem239Q9DA47 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem239Q9DA47 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem239Q9DA47 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem239Q9DA47 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem239Q9DA47 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem239Q9DA47 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem239Q9DA47 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem239Q9DA47 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem239Q9DA47 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem239Q9DA47 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem239Q9DA47 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem239Q9DA47 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem239Q9DA47 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem239Q9DA47 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem239Q9DA47 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem239Q9DA47 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem239Q9DA47 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem239Q9DA47 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem239Q9DA47 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem239Q9DA47 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem239Q9DA47 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem239Q9DA47 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem239Q9DA47 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem239Q9DA47 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem239Q9DA47 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem239Q9DA47 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem239Q9DA47 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem239Q9DA47 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem239Q9DA47 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem239Q9DA47 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem239Q9DA47 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem239Q9DA47 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem239Q9DA47 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem239Q9DA47 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem239Q9DA47 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem239Q9DA47 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem239Q9DA47 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem239Q9DA47 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem239Q9DA47 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem239Q9DA47 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem239Q9DA47 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem239Q9DA47 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem239Q9DA47 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem239Q9DA47 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem239Q9DA47 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem239Q9DA47 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem239Q9DA47 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem239Q9DA47 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem239Q9DA47 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem239Q9DA47 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem239Q9DA47 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem239Q9DA47 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem239Q9DA47 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem239Q9DA47 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem239Q9DA47 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem239Q9DA47 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem239Q9DA47 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem239Q9DA47 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem239Q9DA47 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem239Q9DA47 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem239Q9DA47 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem239Q9DA47 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem239Q9DA47 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem239Q9DA47 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem239Q9DA47 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem239Q9DA47 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem239Q9DA47 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem239Q9DA47 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem239Q9DA47 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem239Q9DA47 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem239Q9DA47 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem239Q9DA47 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem239Q9DA47 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem239Q9DA47 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem239Q9DA47 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem239Q9DA47 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem239Q9DA47 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem239Q9DA47 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem239Q9DA47 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem239Q9DA47 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem239Q9DA47 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem239Q9DA47 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem239Q9DA47 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem239Q9DA47 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem239Q9DA47 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms