Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L0

Uncharacterized protein C11orf52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8L0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D8L0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D8L0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D8L0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D8L0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D8L0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D8L0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D8L0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D8L0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D8L0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D8L0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D8L0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D8L0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D8L0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D8L0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D8L0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D8L0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D8L0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D8L0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D8L0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D8L0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D8L0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D8L0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D8L0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D8L0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D8L0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D8L0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D8L0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D8L0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D8L0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D8L0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D8L0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D8L0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D8L0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D8L0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D8L0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D8L0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D8L0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D8L0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D8L0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D8L0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D8L0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D8L0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D8L0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D8L0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D8L0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D8L0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D8L0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D8L0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D8L0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D8L0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D8L0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D8L0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D8L0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D8L0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D8L0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D8L0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D8L0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D8L0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D8L0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D8L0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D8L0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D8L0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D8L0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D8L0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D8L0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9D8L0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9D8L0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9D8L0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D8L0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D8L0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D8L0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D8L0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D8L0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D8L0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D8L0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D8L0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D8L0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D8L0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D8L0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D8L0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D8L0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D8L0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D8L0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D8L0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D8L0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D8L0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D8L0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D8L0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D8L0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D8L0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D8L0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D8L0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D8L0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D8L0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D8L0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D8L0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D8L0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D8L0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D8L0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms