Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R4

Ddx56, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx56Q9D0R4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddx56Q9D0R4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddx56Q9D0R4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddx56Q9D0R4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddx56Q9D0R4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddx56Q9D0R4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddx56Q9D0R4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx56Q9D0R4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx56Q9D0R4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx56Q9D0R4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx56Q9D0R4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx56Q9D0R4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx56Q9D0R4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddx56Q9D0R4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddx56Q9D0R4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddx56Q9D0R4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddx56Q9D0R4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddx56Q9D0R4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddx56Q9D0R4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddx56Q9D0R4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddx56Q9D0R4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx56Q9D0R4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx56Q9D0R4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx56Q9D0R4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx56Q9D0R4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx56Q9D0R4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx56Q9D0R4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx56Q9D0R4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx56Q9D0R4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx56Q9D0R4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx56Q9D0R4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx56Q9D0R4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx56Q9D0R4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx56Q9D0R4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ddx56Q9D0R4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ddx56Q9D0R4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ddx56Q9D0R4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ddx56Q9D0R4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ddx56Q9D0R4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ddx56Q9D0R4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ddx56Q9D0R4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ddx56Q9D0R4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddx56Q9D0R4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddx56Q9D0R4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddx56Q9D0R4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddx56Q9D0R4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddx56Q9D0R4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddx56Q9D0R4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddx56Q9D0R4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddx56Q9D0R4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddx56Q9D0R4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddx56Q9D0R4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddx56Q9D0R4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddx56Q9D0R4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddx56Q9D0R4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddx56Q9D0R4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddx56Q9D0R4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddx56Q9D0R4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddx56Q9D0R4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddx56Q9D0R4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddx56Q9D0R4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddx56Q9D0R4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddx56Q9D0R4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddx56Q9D0R4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddx56Q9D0R4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddx56Q9D0R4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddx56Q9D0R4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddx56Q9D0R4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddx56Q9D0R4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddx56Q9D0R4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddx56Q9D0R4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddx56Q9D0R4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddx56Q9D0R4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddx56Q9D0R4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ddx56Q9D0R4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ddx56Q9D0R4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ddx56Q9D0R4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ddx56Q9D0R4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ddx56Q9D0R4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ddx56Q9D0R4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ddx56Q9D0R4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ddx56Q9D0R4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ddx56Q9D0R4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ddx56Q9D0R4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ddx56Q9D0R4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddx56Q9D0R4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddx56Q9D0R4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddx56Q9D0R4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddx56Q9D0R4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddx56Q9D0R4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddx56Q9D0R4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddx56Q9D0R4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx56Q9D0R4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx56Q9D0R4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx56Q9D0R4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx56Q9D0R4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx56Q9D0R4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx56Q9D0R4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx56Q9D0R4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx56Q9D0R4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms