Protein–RNA interactions for Protein: Q99P47

Cntnap4, Contactin-associated protein-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap4Q99P47 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cntnap4Q99P47 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cntnap4Q99P47 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cntnap4Q99P47 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cntnap4Q99P47 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cntnap4Q99P47 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cntnap4Q99P47 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cntnap4Q99P47 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cntnap4Q99P47 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cntnap4Q99P47 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cntnap4Q99P47 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cntnap4Q99P47 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cntnap4Q99P47 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cntnap4Q99P47 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cntnap4Q99P47 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cntnap4Q99P47 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cntnap4Q99P47 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cntnap4Q99P47 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cntnap4Q99P47 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cntnap4Q99P47 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cntnap4Q99P47 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cntnap4Q99P47 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cntnap4Q99P47 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cntnap4Q99P47 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cntnap4Q99P47 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cntnap4Q99P47 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cntnap4Q99P47 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cntnap4Q99P47 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cntnap4Q99P47 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cntnap4Q99P47 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cntnap4Q99P47 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cntnap4Q99P47 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cntnap4Q99P47 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cntnap4Q99P47 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cntnap4Q99P47 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cntnap4Q99P47 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cntnap4Q99P47 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cntnap4Q99P47 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cntnap4Q99P47 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cntnap4Q99P47 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cntnap4Q99P47 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cntnap4Q99P47 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cntnap4Q99P47 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cntnap4Q99P47 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cntnap4Q99P47 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cntnap4Q99P47 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cntnap4Q99P47 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cntnap4Q99P47 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cntnap4Q99P47 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cntnap4Q99P47 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cntnap4Q99P47 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cntnap4Q99P47 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cntnap4Q99P47 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cntnap4Q99P47 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cntnap4Q99P47 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cntnap4Q99P47 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cntnap4Q99P47 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cntnap4Q99P47 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cntnap4Q99P47 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cntnap4Q99P47 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cntnap4Q99P47 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cntnap4Q99P47 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cntnap4Q99P47 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntnap4Q99P47 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntnap4Q99P47 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntnap4Q99P47 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntnap4Q99P47 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntnap4Q99P47 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntnap4Q99P47 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntnap4Q99P47 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntnap4Q99P47 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cntnap4Q99P47 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cntnap4Q99P47 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cntnap4Q99P47 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cntnap4Q99P47 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cntnap4Q99P47 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cntnap4Q99P47 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cntnap4Q99P47 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cntnap4Q99P47 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cntnap4Q99P47 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cntnap4Q99P47 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cntnap4Q99P47 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cntnap4Q99P47 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cntnap4Q99P47 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cntnap4Q99P47 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cntnap4Q99P47 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cntnap4Q99P47 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cntnap4Q99P47 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cntnap4Q99P47 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntnap4Q99P47 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntnap4Q99P47 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntnap4Q99P47 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntnap4Q99P47 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntnap4Q99P47 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntnap4Q99P47 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntnap4Q99P47 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntnap4Q99P47 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntnap4Q99P47 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntnap4Q99P47 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntnap4Q99P47 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms