Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME3

Sncaip, Synphilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncaipQ99ME3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SncaipQ99ME3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SncaipQ99ME3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SncaipQ99ME3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SncaipQ99ME3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SncaipQ99ME3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SncaipQ99ME3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SncaipQ99ME3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SncaipQ99ME3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SncaipQ99ME3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SncaipQ99ME3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SncaipQ99ME3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SncaipQ99ME3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SncaipQ99ME3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SncaipQ99ME3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SncaipQ99ME3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SncaipQ99ME3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SncaipQ99ME3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SncaipQ99ME3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SncaipQ99ME3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SncaipQ99ME3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SncaipQ99ME3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SncaipQ99ME3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SncaipQ99ME3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SncaipQ99ME3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SncaipQ99ME3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SncaipQ99ME3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SncaipQ99ME3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SncaipQ99ME3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SncaipQ99ME3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SncaipQ99ME3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SncaipQ99ME3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SncaipQ99ME3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SncaipQ99ME3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SncaipQ99ME3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SncaipQ99ME3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SncaipQ99ME3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SncaipQ99ME3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SncaipQ99ME3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SncaipQ99ME3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SncaipQ99ME3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SncaipQ99ME3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SncaipQ99ME3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SncaipQ99ME3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SncaipQ99ME3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SncaipQ99ME3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SncaipQ99ME3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SncaipQ99ME3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SncaipQ99ME3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SncaipQ99ME3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SncaipQ99ME3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SncaipQ99ME3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SncaipQ99ME3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SncaipQ99ME3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SncaipQ99ME3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SncaipQ99ME3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SncaipQ99ME3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SncaipQ99ME3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SncaipQ99ME3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SncaipQ99ME3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SncaipQ99ME3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SncaipQ99ME3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SncaipQ99ME3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SncaipQ99ME3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SncaipQ99ME3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SncaipQ99ME3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SncaipQ99ME3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SncaipQ99ME3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SncaipQ99ME3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SncaipQ99ME3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SncaipQ99ME3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SncaipQ99ME3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SncaipQ99ME3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SncaipQ99ME3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SncaipQ99ME3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SncaipQ99ME3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SncaipQ99ME3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SncaipQ99ME3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SncaipQ99ME3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SncaipQ99ME3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SncaipQ99ME3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SncaipQ99ME3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SncaipQ99ME3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SncaipQ99ME3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SncaipQ99ME3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SncaipQ99ME3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SncaipQ99ME3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SncaipQ99ME3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SncaipQ99ME3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SncaipQ99ME3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SncaipQ99ME3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SncaipQ99ME3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SncaipQ99ME3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SncaipQ99ME3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SncaipQ99ME3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SncaipQ99ME3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SncaipQ99ME3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SncaipQ99ME3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SncaipQ99ME3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SncaipQ99ME3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms