Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ5

Cmtm3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm3Q99LJ5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmtm3Q99LJ5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmtm3Q99LJ5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmtm3Q99LJ5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmtm3Q99LJ5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmtm3Q99LJ5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cmtm3Q99LJ5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cmtm3Q99LJ5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cmtm3Q99LJ5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cmtm3Q99LJ5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cmtm3Q99LJ5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cmtm3Q99LJ5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cmtm3Q99LJ5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cmtm3Q99LJ5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cmtm3Q99LJ5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cmtm3Q99LJ5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cmtm3Q99LJ5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cmtm3Q99LJ5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cmtm3Q99LJ5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cmtm3Q99LJ5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cmtm3Q99LJ5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cmtm3Q99LJ5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cmtm3Q99LJ5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cmtm3Q99LJ5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cmtm3Q99LJ5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cmtm3Q99LJ5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cmtm3Q99LJ5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cmtm3Q99LJ5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cmtm3Q99LJ5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cmtm3Q99LJ5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cmtm3Q99LJ5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cmtm3Q99LJ5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cmtm3Q99LJ5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cmtm3Q99LJ5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cmtm3Q99LJ5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cmtm3Q99LJ5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cmtm3Q99LJ5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cmtm3Q99LJ5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cmtm3Q99LJ5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cmtm3Q99LJ5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cmtm3Q99LJ5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cmtm3Q99LJ5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cmtm3Q99LJ5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cmtm3Q99LJ5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cmtm3Q99LJ5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cmtm3Q99LJ5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cmtm3Q99LJ5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cmtm3Q99LJ5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cmtm3Q99LJ5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cmtm3Q99LJ5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cmtm3Q99LJ5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cmtm3Q99LJ5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cmtm3Q99LJ5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cmtm3Q99LJ5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cmtm3Q99LJ5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cmtm3Q99LJ5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cmtm3Q99LJ5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cmtm3Q99LJ5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmtm3Q99LJ5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmtm3Q99LJ5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmtm3Q99LJ5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmtm3Q99LJ5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmtm3Q99LJ5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmtm3Q99LJ5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmtm3Q99LJ5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmtm3Q99LJ5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmtm3Q99LJ5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmtm3Q99LJ5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmtm3Q99LJ5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmtm3Q99LJ5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmtm3Q99LJ5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmtm3Q99LJ5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmtm3Q99LJ5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmtm3Q99LJ5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmtm3Q99LJ5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmtm3Q99LJ5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmtm3Q99LJ5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmtm3Q99LJ5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmtm3Q99LJ5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cmtm3Q99LJ5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cmtm3Q99LJ5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cmtm3Q99LJ5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cmtm3Q99LJ5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmtm3Q99LJ5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmtm3Q99LJ5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmtm3Q99LJ5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmtm3Q99LJ5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmtm3Q99LJ5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmtm3Q99LJ5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmtm3Q99LJ5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmtm3Q99LJ5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmtm3Q99LJ5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmtm3Q99LJ5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmtm3Q99LJ5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmtm3Q99LJ5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmtm3Q99LJ5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmtm3Q99LJ5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmtm3Q99LJ5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmtm3Q99LJ5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmtm3Q99LJ5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms