Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Reep3Q99KK1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Reep3Q99KK1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Reep3Q99KK1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Reep3Q99KK1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Reep3Q99KK1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Reep3Q99KK1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Reep3Q99KK1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Reep3Q99KK1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Reep3Q99KK1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Reep3Q99KK1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Reep3Q99KK1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Reep3Q99KK1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Reep3Q99KK1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Reep3Q99KK1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Reep3Q99KK1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Reep3Q99KK1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Reep3Q99KK1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Reep3Q99KK1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Reep3Q99KK1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Reep3Q99KK1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Reep3Q99KK1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Reep3Q99KK1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Reep3Q99KK1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Reep3Q99KK1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Reep3Q99KK1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Reep3Q99KK1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Reep3Q99KK1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Reep3Q99KK1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Reep3Q99KK1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Reep3Q99KK1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Reep3Q99KK1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Reep3Q99KK1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Reep3Q99KK1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Reep3Q99KK1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Reep3Q99KK1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Reep3Q99KK1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Reep3Q99KK1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Reep3Q99KK1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Reep3Q99KK1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Reep3Q99KK1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Reep3Q99KK1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Reep3Q99KK1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Reep3Q99KK1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Reep3Q99KK1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Reep3Q99KK1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Reep3Q99KK1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Reep3Q99KK1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Reep3Q99KK1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Reep3Q99KK1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Reep3Q99KK1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Reep3Q99KK1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Reep3Q99KK1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Reep3Q99KK1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Reep3Q99KK1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Reep3Q99KK1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Reep3Q99KK1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Reep3Q99KK1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Reep3Q99KK1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Reep3Q99KK1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Reep3Q99KK1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Reep3Q99KK1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Reep3Q99KK1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Reep3Q99KK1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Reep3Q99KK1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Reep3Q99KK1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Reep3Q99KK1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Reep3Q99KK1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Reep3Q99KK1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Reep3Q99KK1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Reep3Q99KK1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Reep3Q99KK1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Reep3Q99KK1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Reep3Q99KK1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Reep3Q99KK1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Reep3Q99KK1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Reep3Q99KK1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Reep3Q99KK1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Reep3Q99KK1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Reep3Q99KK1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Reep3Q99KK1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Reep3Q99KK1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Reep3Q99KK1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Reep3Q99KK1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Reep3Q99KK1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Reep3Q99KK1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Reep3Q99KK1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Reep3Q99KK1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Reep3Q99KK1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Reep3Q99KK1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Reep3Q99KK1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Reep3Q99KK1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Reep3Q99KK1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Reep3Q99KK1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Reep3Q99KK1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Reep3Q99KK1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Reep3Q99KK1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Reep3Q99KK1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Reep3Q99KK1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Reep3Q99KK1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms