Protein–RNA interactions for Protein: Q99JG7

Tnip2, TNFAIP3-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip2Q99JG7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnip2Q99JG7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnip2Q99JG7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnip2Q99JG7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tnip2Q99JG7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tnip2Q99JG7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tnip2Q99JG7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tnip2Q99JG7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnip2Q99JG7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnip2Q99JG7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnip2Q99JG7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnip2Q99JG7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnip2Q99JG7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnip2Q99JG7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnip2Q99JG7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnip2Q99JG7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnip2Q99JG7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnip2Q99JG7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnip2Q99JG7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnip2Q99JG7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnip2Q99JG7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnip2Q99JG7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnip2Q99JG7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnip2Q99JG7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnip2Q99JG7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnip2Q99JG7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnip2Q99JG7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnip2Q99JG7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnip2Q99JG7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnip2Q99JG7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnip2Q99JG7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnip2Q99JG7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnip2Q99JG7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnip2Q99JG7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnip2Q99JG7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnip2Q99JG7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnip2Q99JG7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnip2Q99JG7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnip2Q99JG7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnip2Q99JG7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnip2Q99JG7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnip2Q99JG7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnip2Q99JG7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnip2Q99JG7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnip2Q99JG7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnip2Q99JG7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnip2Q99JG7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnip2Q99JG7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnip2Q99JG7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnip2Q99JG7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnip2Q99JG7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnip2Q99JG7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnip2Q99JG7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnip2Q99JG7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnip2Q99JG7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnip2Q99JG7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnip2Q99JG7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnip2Q99JG7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnip2Q99JG7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnip2Q99JG7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnip2Q99JG7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnip2Q99JG7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnip2Q99JG7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnip2Q99JG7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnip2Q99JG7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnip2Q99JG7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnip2Q99JG7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnip2Q99JG7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnip2Q99JG7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnip2Q99JG7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnip2Q99JG7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnip2Q99JG7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnip2Q99JG7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnip2Q99JG7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnip2Q99JG7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnip2Q99JG7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnip2Q99JG7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnip2Q99JG7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnip2Q99JG7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnip2Q99JG7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnip2Q99JG7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnip2Q99JG7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnip2Q99JG7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnip2Q99JG7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnip2Q99JG7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnip2Q99JG7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnip2Q99JG7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnip2Q99JG7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnip2Q99JG7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnip2Q99JG7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnip2Q99JG7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnip2Q99JG7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnip2Q99JG7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnip2Q99JG7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnip2Q99JG7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnip2Q99JG7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnip2Q99JG7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnip2Q99JG7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnip2Q99JG7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnip2Q99JG7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms