Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf144aQ925F3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf144aQ925F3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf144aQ925F3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf144aQ925F3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf144aQ925F3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf144aQ925F3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf144aQ925F3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf144aQ925F3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf144aQ925F3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf144aQ925F3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf144aQ925F3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf144aQ925F3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf144aQ925F3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf144aQ925F3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf144aQ925F3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf144aQ925F3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf144aQ925F3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf144aQ925F3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf144aQ925F3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf144aQ925F3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnf144aQ925F3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnf144aQ925F3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnf144aQ925F3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnf144aQ925F3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rnf144aQ925F3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf144aQ925F3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf144aQ925F3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf144aQ925F3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf144aQ925F3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf144aQ925F3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf144aQ925F3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf144aQ925F3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf144aQ925F3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf144aQ925F3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf144aQ925F3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf144aQ925F3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf144aQ925F3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf144aQ925F3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf144aQ925F3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf144aQ925F3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf144aQ925F3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf144aQ925F3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf144aQ925F3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf144aQ925F3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf144aQ925F3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf144aQ925F3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf144aQ925F3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf144aQ925F3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf144aQ925F3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf144aQ925F3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf144aQ925F3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf144aQ925F3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf144aQ925F3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf144aQ925F3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf144aQ925F3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf144aQ925F3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf144aQ925F3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf144aQ925F3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf144aQ925F3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf144aQ925F3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf144aQ925F3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf144aQ925F3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf144aQ925F3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf144aQ925F3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnf144aQ925F3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnf144aQ925F3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnf144aQ925F3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnf144aQ925F3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnf144aQ925F3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnf144aQ925F3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnf144aQ925F3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rnf144aQ925F3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rnf144aQ925F3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rnf144aQ925F3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf144aQ925F3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf144aQ925F3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf144aQ925F3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf144aQ925F3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf144aQ925F3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf144aQ925F3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf144aQ925F3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf144aQ925F3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf144aQ925F3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf144aQ925F3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf144aQ925F3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf144aQ925F3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf144aQ925F3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf144aQ925F3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf144aQ925F3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf144aQ925F3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf144aQ925F3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf144aQ925F3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf144aQ925F3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf144aQ925F3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf144aQ925F3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf144aQ925F3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf144aQ925F3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf144aQ925F3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf144aQ925F3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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