Protein–RNA interactions for Protein: Q91YY4

Atpaf2, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atpaf2Q91YY4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atpaf2Q91YY4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atpaf2Q91YY4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atpaf2Q91YY4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atpaf2Q91YY4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atpaf2Q91YY4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atpaf2Q91YY4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atpaf2Q91YY4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atpaf2Q91YY4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atpaf2Q91YY4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atpaf2Q91YY4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atpaf2Q91YY4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atpaf2Q91YY4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atpaf2Q91YY4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atpaf2Q91YY4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atpaf2Q91YY4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atpaf2Q91YY4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atpaf2Q91YY4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Atpaf2Q91YY4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atpaf2Q91YY4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Atpaf2Q91YY4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atpaf2Q91YY4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atpaf2Q91YY4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atpaf2Q91YY4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atpaf2Q91YY4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atpaf2Q91YY4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atpaf2Q91YY4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atpaf2Q91YY4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atpaf2Q91YY4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atpaf2Q91YY4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Atpaf2Q91YY4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atpaf2Q91YY4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atpaf2Q91YY4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Atpaf2Q91YY4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atpaf2Q91YY4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atpaf2Q91YY4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atpaf2Q91YY4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atpaf2Q91YY4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atpaf2Q91YY4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atpaf2Q91YY4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atpaf2Q91YY4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atpaf2Q91YY4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atpaf2Q91YY4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atpaf2Q91YY4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atpaf2Q91YY4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atpaf2Q91YY4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atpaf2Q91YY4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atpaf2Q91YY4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atpaf2Q91YY4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atpaf2Q91YY4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Atpaf2Q91YY4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atpaf2Q91YY4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atpaf2Q91YY4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atpaf2Q91YY4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atpaf2Q91YY4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atpaf2Q91YY4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atpaf2Q91YY4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atpaf2Q91YY4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atpaf2Q91YY4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atpaf2Q91YY4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atpaf2Q91YY4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atpaf2Q91YY4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atpaf2Q91YY4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atpaf2Q91YY4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atpaf2Q91YY4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atpaf2Q91YY4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Atpaf2Q91YY4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atpaf2Q91YY4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Atpaf2Q91YY4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atpaf2Q91YY4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atpaf2Q91YY4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atpaf2Q91YY4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atpaf2Q91YY4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atpaf2Q91YY4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atpaf2Q91YY4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atpaf2Q91YY4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atpaf2Q91YY4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atpaf2Q91YY4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atpaf2Q91YY4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atpaf2Q91YY4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atpaf2Q91YY4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atpaf2Q91YY4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atpaf2Q91YY4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atpaf2Q91YY4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atpaf2Q91YY4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atpaf2Q91YY4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atpaf2Q91YY4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atpaf2Q91YY4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atpaf2Q91YY4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atpaf2Q91YY4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atpaf2Q91YY4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atpaf2Q91YY4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Atpaf2Q91YY4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atpaf2Q91YY4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atpaf2Q91YY4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atpaf2Q91YY4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atpaf2Q91YY4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atpaf2Q91YY4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atpaf2Q91YY4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atpaf2Q91YY4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms