Protein–RNA interactions for Protein: Q91WK0

Lrrfip2, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip2Q91WK0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrfip2Q91WK0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrfip2Q91WK0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrfip2Q91WK0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrfip2Q91WK0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrfip2Q91WK0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrfip2Q91WK0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrfip2Q91WK0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrfip2Q91WK0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrfip2Q91WK0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrfip2Q91WK0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrfip2Q91WK0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrfip2Q91WK0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrfip2Q91WK0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrfip2Q91WK0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrfip2Q91WK0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrfip2Q91WK0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrfip2Q91WK0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrfip2Q91WK0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrfip2Q91WK0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrfip2Q91WK0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrrfip2Q91WK0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrrfip2Q91WK0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrrfip2Q91WK0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrrfip2Q91WK0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrrfip2Q91WK0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrrfip2Q91WK0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrrfip2Q91WK0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrfip2Q91WK0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrfip2Q91WK0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrfip2Q91WK0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrfip2Q91WK0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrfip2Q91WK0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrrfip2Q91WK0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Lrrfip2Q91WK0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Lrrfip2Q91WK0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrfip2Q91WK0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrfip2Q91WK0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrfip2Q91WK0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrfip2Q91WK0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrfip2Q91WK0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrfip2Q91WK0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrfip2Q91WK0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrfip2Q91WK0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrfip2Q91WK0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrfip2Q91WK0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrfip2Q91WK0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrfip2Q91WK0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrfip2Q91WK0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrfip2Q91WK0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrfip2Q91WK0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrfip2Q91WK0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrfip2Q91WK0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrrfip2Q91WK0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrrfip2Q91WK0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrrfip2Q91WK0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrrfip2Q91WK0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrrfip2Q91WK0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrrfip2Q91WK0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrrfip2Q91WK0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrrfip2Q91WK0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrrfip2Q91WK0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrrfip2Q91WK0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrrfip2Q91WK0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrrfip2Q91WK0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrrfip2Q91WK0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrrfip2Q91WK0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrrfip2Q91WK0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrrfip2Q91WK0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrfip2Q91WK0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrfip2Q91WK0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrfip2Q91WK0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrfip2Q91WK0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrfip2Q91WK0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrfip2Q91WK0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrfip2Q91WK0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrfip2Q91WK0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrfip2Q91WK0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrfip2Q91WK0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrfip2Q91WK0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrfip2Q91WK0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrfip2Q91WK0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrfip2Q91WK0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrfip2Q91WK0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrfip2Q91WK0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrfip2Q91WK0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrfip2Q91WK0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrfip2Q91WK0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrfip2Q91WK0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrfip2Q91WK0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrfip2Q91WK0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrfip2Q91WK0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrfip2Q91WK0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrfip2Q91WK0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrfip2Q91WK0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrfip2Q91WK0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrfip2Q91WK0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrfip2Q91WK0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrfip2Q91WK0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrrfip2Q91WK0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.6 ms