Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg10Q8R1P4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg10Q8R1P4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg10Q8R1P4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg10Q8R1P4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg10Q8R1P4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg10Q8R1P4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg10Q8R1P4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg10Q8R1P4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg10Q8R1P4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg10Q8R1P4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg10Q8R1P4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg10Q8R1P4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg10Q8R1P4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg10Q8R1P4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg10Q8R1P4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg10Q8R1P4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg10Q8R1P4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg10Q8R1P4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg10Q8R1P4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg10Q8R1P4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg10Q8R1P4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg10Q8R1P4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg10Q8R1P4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg10Q8R1P4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg10Q8R1P4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg10Q8R1P4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg10Q8R1P4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg10Q8R1P4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg10Q8R1P4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg10Q8R1P4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg10Q8R1P4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg10Q8R1P4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg10Q8R1P4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg10Q8R1P4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg10Q8R1P4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atg10Q8R1P4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atg10Q8R1P4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atg10Q8R1P4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atg10Q8R1P4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg10Q8R1P4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg10Q8R1P4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Atg10Q8R1P4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg10Q8R1P4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg10Q8R1P4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Atg10Q8R1P4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg10Q8R1P4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg10Q8R1P4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg10Q8R1P4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg10Q8R1P4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg10Q8R1P4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg10Q8R1P4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg10Q8R1P4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Atg10Q8R1P4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Atg10Q8R1P4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg10Q8R1P4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg10Q8R1P4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg10Q8R1P4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atg10Q8R1P4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atg10Q8R1P4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Atg10Q8R1P4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Atg10Q8R1P4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atg10Q8R1P4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Atg10Q8R1P4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atg10Q8R1P4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atg10Q8R1P4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atg10Q8R1P4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atg10Q8R1P4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Atg10Q8R1P4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Atg10Q8R1P4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Atg10Q8R1P4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atg10Q8R1P4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atg10Q8R1P4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atg10Q8R1P4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atg10Q8R1P4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg10Q8R1P4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg10Q8R1P4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg10Q8R1P4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg10Q8R1P4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg10Q8R1P4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg10Q8R1P4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg10Q8R1P4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg10Q8R1P4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg10Q8R1P4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg10Q8R1P4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg10Q8R1P4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg10Q8R1P4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg10Q8R1P4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg10Q8R1P4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg10Q8R1P4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg10Q8R1P4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg10Q8R1P4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg10Q8R1P4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg10Q8R1P4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg10Q8R1P4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg10Q8R1P4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg10Q8R1P4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg10Q8R1P4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg10Q8R1P4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg10Q8R1P4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms