Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrtm1Q8K377 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrtm1Q8K377 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrtm1Q8K377 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrtm1Q8K377 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrtm1Q8K377 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrtm1Q8K377 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrtm1Q8K377 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrtm1Q8K377 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrtm1Q8K377 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrtm1Q8K377 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrtm1Q8K377 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrtm1Q8K377 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrtm1Q8K377 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrtm1Q8K377 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrtm1Q8K377 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrtm1Q8K377 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrtm1Q8K377 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrtm1Q8K377 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrtm1Q8K377 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrtm1Q8K377 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrtm1Q8K377 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrtm1Q8K377 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrtm1Q8K377 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrtm1Q8K377 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrtm1Q8K377 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrtm1Q8K377 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrtm1Q8K377 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrtm1Q8K377 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrtm1Q8K377 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrtm1Q8K377 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lrrtm1Q8K377 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrtm1Q8K377 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrtm1Q8K377 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrtm1Q8K377 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrtm1Q8K377 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrtm1Q8K377 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrtm1Q8K377 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrtm1Q8K377 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrtm1Q8K377 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrtm1Q8K377 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrtm1Q8K377 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrtm1Q8K377 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrtm1Q8K377 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrtm1Q8K377 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrtm1Q8K377 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrtm1Q8K377 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrtm1Q8K377 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrtm1Q8K377 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrtm1Q8K377 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrtm1Q8K377 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrtm1Q8K377 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrtm1Q8K377 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrtm1Q8K377 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrtm1Q8K377 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrtm1Q8K377 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrtm1Q8K377 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrtm1Q8K377 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrtm1Q8K377 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrtm1Q8K377 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrtm1Q8K377 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrtm1Q8K377 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrtm1Q8K377 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrtm1Q8K377 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrtm1Q8K377 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrtm1Q8K377 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrtm1Q8K377 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrtm1Q8K377 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrtm1Q8K377 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrtm1Q8K377 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrtm1Q8K377 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrtm1Q8K377 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrtm1Q8K377 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrtm1Q8K377 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrtm1Q8K377 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrtm1Q8K377 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrtm1Q8K377 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrtm1Q8K377 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrtm1Q8K377 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrrtm1Q8K377 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrrtm1Q8K377 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrtm1Q8K377 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrtm1Q8K377 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrtm1Q8K377 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrtm1Q8K377 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrtm1Q8K377 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrtm1Q8K377 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrtm1Q8K377 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrtm1Q8K377 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrtm1Q8K377 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrtm1Q8K377 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrtm1Q8K377 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrtm1Q8K377 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrtm1Q8K377 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrtm1Q8K377 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrtm1Q8K377 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrtm1Q8K377 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrtm1Q8K377 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrtm1Q8K377 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrtm1Q8K377 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms