Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Polr1eQ8K202 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Polr1eQ8K202 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Polr1eQ8K202 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Polr1eQ8K202 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Polr1eQ8K202 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Polr1eQ8K202 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Polr1eQ8K202 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Polr1eQ8K202 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Polr1eQ8K202 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Polr1eQ8K202 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Polr1eQ8K202 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Polr1eQ8K202 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Polr1eQ8K202 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Polr1eQ8K202 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Polr1eQ8K202 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Polr1eQ8K202 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Polr1eQ8K202 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Polr1eQ8K202 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Polr1eQ8K202 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Polr1eQ8K202 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Polr1eQ8K202 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Polr1eQ8K202 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Polr1eQ8K202 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Polr1eQ8K202 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Polr1eQ8K202 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Polr1eQ8K202 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Polr1eQ8K202 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Polr1eQ8K202 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Polr1eQ8K202 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Polr1eQ8K202 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Polr1eQ8K202 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Polr1eQ8K202 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Polr1eQ8K202 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Polr1eQ8K202 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Polr1eQ8K202 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Polr1eQ8K202 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Polr1eQ8K202 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Polr1eQ8K202 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Polr1eQ8K202 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Polr1eQ8K202 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Polr1eQ8K202 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Polr1eQ8K202 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Polr1eQ8K202 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Polr1eQ8K202 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Polr1eQ8K202 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Polr1eQ8K202 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Polr1eQ8K202 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Polr1eQ8K202 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Polr1eQ8K202 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Polr1eQ8K202 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Polr1eQ8K202 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Polr1eQ8K202 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Polr1eQ8K202 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Polr1eQ8K202 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Polr1eQ8K202 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Polr1eQ8K202 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Polr1eQ8K202 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Polr1eQ8K202 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Polr1eQ8K202 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Polr1eQ8K202 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Polr1eQ8K202 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Polr1eQ8K202 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Polr1eQ8K202 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Polr1eQ8K202 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Polr1eQ8K202 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Polr1eQ8K202 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Polr1eQ8K202 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Polr1eQ8K202 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Polr1eQ8K202 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Polr1eQ8K202 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Polr1eQ8K202 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Polr1eQ8K202 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Polr1eQ8K202 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Polr1eQ8K202 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Polr1eQ8K202 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Polr1eQ8K202 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Polr1eQ8K202 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Polr1eQ8K202 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Polr1eQ8K202 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Polr1eQ8K202 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Polr1eQ8K202 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Polr1eQ8K202 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Polr1eQ8K202 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Polr1eQ8K202 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Polr1eQ8K202 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Polr1eQ8K202 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Polr1eQ8K202 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Polr1eQ8K202 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Polr1eQ8K202 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Polr1eQ8K202 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Polr1eQ8K202 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Polr1eQ8K202 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Polr1eQ8K202 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Polr1eQ8K202 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Polr1eQ8K202 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Polr1eQ8K202 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Polr1eQ8K202 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Polr1eQ8K202 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Polr1eQ8K202 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms