Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc28aQ8CEI3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc28aQ8CEI3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc28aQ8CEI3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc28aQ8CEI3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc28aQ8CEI3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc28aQ8CEI3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc28aQ8CEI3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc28aQ8CEI3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc28aQ8CEI3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc28aQ8CEI3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc28aQ8CEI3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc28aQ8CEI3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc28aQ8CEI3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc28aQ8CEI3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc28aQ8CEI3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc28aQ8CEI3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc28aQ8CEI3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc28aQ8CEI3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc28aQ8CEI3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc28aQ8CEI3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc28aQ8CEI3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc28aQ8CEI3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc28aQ8CEI3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc28aQ8CEI3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc28aQ8CEI3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc28aQ8CEI3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc28aQ8CEI3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc28aQ8CEI3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc28aQ8CEI3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc28aQ8CEI3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc28aQ8CEI3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc28aQ8CEI3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc28aQ8CEI3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc28aQ8CEI3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc28aQ8CEI3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc28aQ8CEI3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc28aQ8CEI3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc28aQ8CEI3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc28aQ8CEI3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc28aQ8CEI3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc28aQ8CEI3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc28aQ8CEI3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc28aQ8CEI3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc28aQ8CEI3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc28aQ8CEI3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc28aQ8CEI3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc28aQ8CEI3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc28aQ8CEI3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc28aQ8CEI3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc28aQ8CEI3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc28aQ8CEI3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc28aQ8CEI3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc28aQ8CEI3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc28aQ8CEI3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc28aQ8CEI3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc28aQ8CEI3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc28aQ8CEI3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc28aQ8CEI3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc28aQ8CEI3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc28aQ8CEI3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc28aQ8CEI3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc28aQ8CEI3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc28aQ8CEI3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc28aQ8CEI3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc28aQ8CEI3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc28aQ8CEI3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc28aQ8CEI3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc28aQ8CEI3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc28aQ8CEI3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc28aQ8CEI3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc28aQ8CEI3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc28aQ8CEI3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc28aQ8CEI3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc28aQ8CEI3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc28aQ8CEI3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc28aQ8CEI3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc28aQ8CEI3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc28aQ8CEI3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc28aQ8CEI3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc28aQ8CEI3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc28aQ8CEI3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc28aQ8CEI3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc28aQ8CEI3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc28aQ8CEI3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc28aQ8CEI3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc28aQ8CEI3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc28aQ8CEI3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc28aQ8CEI3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc28aQ8CEI3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc28aQ8CEI3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms