Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Ppfibp1Q8C8U0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppfibp1Q8C8U0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppfibp1Q8C8U0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppfibp1Q8C8U0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppfibp1Q8C8U0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppfibp1Q8C8U0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppfibp1Q8C8U0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppfibp1Q8C8U0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppfibp1Q8C8U0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppfibp1Q8C8U0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppfibp1Q8C8U0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppfibp1Q8C8U0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppfibp1Q8C8U0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppfibp1Q8C8U0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppfibp1Q8C8U0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppfibp1Q8C8U0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppfibp1Q8C8U0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppfibp1Q8C8U0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppfibp1Q8C8U0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppfibp1Q8C8U0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppfibp1Q8C8U0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ppfibp1Q8C8U0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ppfibp1Q8C8U0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ppfibp1Q8C8U0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ppfibp1Q8C8U0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ppfibp1Q8C8U0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ppfibp1Q8C8U0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ppfibp1Q8C8U0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ppfibp1Q8C8U0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppfibp1Q8C8U0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppfibp1Q8C8U0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppfibp1Q8C8U0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppfibp1Q8C8U0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppfibp1Q8C8U0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppfibp1Q8C8U0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppfibp1Q8C8U0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppfibp1Q8C8U0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppfibp1Q8C8U0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppfibp1Q8C8U0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppfibp1Q8C8U0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppfibp1Q8C8U0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppfibp1Q8C8U0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppfibp1Q8C8U0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppfibp1Q8C8U0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppfibp1Q8C8U0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppfibp1Q8C8U0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppfibp1Q8C8U0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppfibp1Q8C8U0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppfibp1Q8C8U0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppfibp1Q8C8U0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppfibp1Q8C8U0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppfibp1Q8C8U0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppfibp1Q8C8U0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppfibp1Q8C8U0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppfibp1Q8C8U0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppfibp1Q8C8U0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppfibp1Q8C8U0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppfibp1Q8C8U0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppfibp1Q8C8U0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppfibp1Q8C8U0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppfibp1Q8C8U0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppfibp1Q8C8U0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ppfibp1Q8C8U0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ppfibp1Q8C8U0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ppfibp1Q8C8U0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ppfibp1Q8C8U0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ppfibp1Q8C8U0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ppfibp1Q8C8U0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ppfibp1Q8C8U0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ppfibp1Q8C8U0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ppfibp1Q8C8U0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppfibp1Q8C8U0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppfibp1Q8C8U0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppfibp1Q8C8U0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppfibp1Q8C8U0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppfibp1Q8C8U0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppfibp1Q8C8U0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppfibp1Q8C8U0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppfibp1Q8C8U0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppfibp1Q8C8U0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppfibp1Q8C8U0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ppfibp1Q8C8U0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ppfibp1Q8C8U0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ppfibp1Q8C8U0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ppfibp1Q8C8U0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ppfibp1Q8C8U0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppfibp1Q8C8U0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppfibp1Q8C8U0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppfibp1Q8C8U0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppfibp1Q8C8U0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppfibp1Q8C8U0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppfibp1Q8C8U0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppfibp1Q8C8U0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppfibp1Q8C8U0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppfibp1Q8C8U0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppfibp1Q8C8U0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppfibp1Q8C8U0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms