Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3D3

Gm5468, Predicted gene 5468, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5468Q8C3D3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5468Q8C3D3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5468Q8C3D3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5468Q8C3D3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5468Q8C3D3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5468Q8C3D3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5468Q8C3D3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5468Q8C3D3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5468Q8C3D3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5468Q8C3D3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5468Q8C3D3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5468Q8C3D3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5468Q8C3D3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5468Q8C3D3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5468Q8C3D3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5468Q8C3D3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5468Q8C3D3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5468Q8C3D3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5468Q8C3D3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5468Q8C3D3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5468Q8C3D3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm5468Q8C3D3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5468Q8C3D3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5468Q8C3D3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5468Q8C3D3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5468Q8C3D3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5468Q8C3D3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5468Q8C3D3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5468Q8C3D3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5468Q8C3D3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5468Q8C3D3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5468Q8C3D3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5468Q8C3D3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5468Q8C3D3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5468Q8C3D3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5468Q8C3D3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5468Q8C3D3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5468Q8C3D3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5468Q8C3D3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5468Q8C3D3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5468Q8C3D3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5468Q8C3D3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5468Q8C3D3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5468Q8C3D3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5468Q8C3D3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5468Q8C3D3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5468Q8C3D3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5468Q8C3D3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5468Q8C3D3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5468Q8C3D3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5468Q8C3D3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5468Q8C3D3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5468Q8C3D3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5468Q8C3D3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5468Q8C3D3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5468Q8C3D3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5468Q8C3D3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5468Q8C3D3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5468Q8C3D3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5468Q8C3D3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5468Q8C3D3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5468Q8C3D3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5468Q8C3D3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5468Q8C3D3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5468Q8C3D3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5468Q8C3D3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5468Q8C3D3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5468Q8C3D3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5468Q8C3D3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5468Q8C3D3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5468Q8C3D3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5468Q8C3D3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5468Q8C3D3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5468Q8C3D3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5468Q8C3D3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5468Q8C3D3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5468Q8C3D3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5468Q8C3D3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5468Q8C3D3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5468Q8C3D3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5468Q8C3D3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5468Q8C3D3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5468Q8C3D3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5468Q8C3D3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5468Q8C3D3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5468Q8C3D3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5468Q8C3D3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5468Q8C3D3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5468Q8C3D3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5468Q8C3D3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5468Q8C3D3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5468Q8C3D3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5468Q8C3D3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5468Q8C3D3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5468Q8C3D3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5468Q8C3D3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5468Q8C3D3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5468Q8C3D3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5468Q8C3D3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5468Q8C3D3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms