Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

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Length 628 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nek11Q8C0Q4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nek11Q8C0Q4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Nek11Q8C0Q4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nek11Q8C0Q4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nek11Q8C0Q4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nek11Q8C0Q4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nek11Q8C0Q4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nek11Q8C0Q4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nek11Q8C0Q4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nek11Q8C0Q4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nek11Q8C0Q4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nek11Q8C0Q4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nek11Q8C0Q4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nek11Q8C0Q4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nek11Q8C0Q4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nek11Q8C0Q4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nek11Q8C0Q4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nek11Q8C0Q4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nek11Q8C0Q4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nek11Q8C0Q4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nek11Q8C0Q4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Nek11Q8C0Q4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nek11Q8C0Q4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nek11Q8C0Q4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nek11Q8C0Q4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nek11Q8C0Q4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nek11Q8C0Q4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nek11Q8C0Q4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nek11Q8C0Q4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nek11Q8C0Q4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nek11Q8C0Q4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nek11Q8C0Q4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nek11Q8C0Q4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nek11Q8C0Q4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nek11Q8C0Q4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nek11Q8C0Q4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nek11Q8C0Q4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nek11Q8C0Q4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nek11Q8C0Q4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nek11Q8C0Q4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nek11Q8C0Q4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nek11Q8C0Q4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nek11Q8C0Q4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nek11Q8C0Q4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nek11Q8C0Q4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nek11Q8C0Q4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nek11Q8C0Q4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nek11Q8C0Q4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Nek11Q8C0Q4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nek11Q8C0Q4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nek11Q8C0Q4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nek11Q8C0Q4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nek11Q8C0Q4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nek11Q8C0Q4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nek11Q8C0Q4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nek11Q8C0Q4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Nek11Q8C0Q4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nek11Q8C0Q4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nek11Q8C0Q4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nek11Q8C0Q4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nek11Q8C0Q4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nek11Q8C0Q4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nek11Q8C0Q4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nek11Q8C0Q4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nek11Q8C0Q4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nek11Q8C0Q4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nek11Q8C0Q4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nek11Q8C0Q4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nek11Q8C0Q4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nek11Q8C0Q4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nek11Q8C0Q4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nek11Q8C0Q4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nek11Q8C0Q4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Nek11Q8C0Q4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nek11Q8C0Q4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nek11Q8C0Q4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nek11Q8C0Q4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nek11Q8C0Q4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nek11Q8C0Q4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nek11Q8C0Q4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Nek11Q8C0Q4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nek11Q8C0Q4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nek11Q8C0Q4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nek11Q8C0Q4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nek11Q8C0Q4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nek11Q8C0Q4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nek11Q8C0Q4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nek11Q8C0Q4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nek11Q8C0Q4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nek11Q8C0Q4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nek11Q8C0Q4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nek11Q8C0Q4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nek11Q8C0Q4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nek11Q8C0Q4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Nek11Q8C0Q4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Nek11Q8C0Q4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Nek11Q8C0Q4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nek11Q8C0Q4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nek11Q8C0Q4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
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