Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU40

Nlrp4a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4aQ8BU40 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlrp4aQ8BU40 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlrp4aQ8BU40 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlrp4aQ8BU40 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlrp4aQ8BU40 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlrp4aQ8BU40 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlrp4aQ8BU40 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlrp4aQ8BU40 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlrp4aQ8BU40 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlrp4aQ8BU40 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlrp4aQ8BU40 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlrp4aQ8BU40 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlrp4aQ8BU40 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlrp4aQ8BU40 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlrp4aQ8BU40 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlrp4aQ8BU40 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlrp4aQ8BU40 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlrp4aQ8BU40 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlrp4aQ8BU40 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlrp4aQ8BU40 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlrp4aQ8BU40 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlrp4aQ8BU40 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlrp4aQ8BU40 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlrp4aQ8BU40 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlrp4aQ8BU40 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlrp4aQ8BU40 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlrp4aQ8BU40 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlrp4aQ8BU40 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlrp4aQ8BU40 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrp4aQ8BU40 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrp4aQ8BU40 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrp4aQ8BU40 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrp4aQ8BU40 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrp4aQ8BU40 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrp4aQ8BU40 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrp4aQ8BU40 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrp4aQ8BU40 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrp4aQ8BU40 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlrp4aQ8BU40 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlrp4aQ8BU40 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlrp4aQ8BU40 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlrp4aQ8BU40 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlrp4aQ8BU40 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlrp4aQ8BU40 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlrp4aQ8BU40 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlrp4aQ8BU40 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlrp4aQ8BU40 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrp4aQ8BU40 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrp4aQ8BU40 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrp4aQ8BU40 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrp4aQ8BU40 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrp4aQ8BU40 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrp4aQ8BU40 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrp4aQ8BU40 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrp4aQ8BU40 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrp4aQ8BU40 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrp4aQ8BU40 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrp4aQ8BU40 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrp4aQ8BU40 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrp4aQ8BU40 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrp4aQ8BU40 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrp4aQ8BU40 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrp4aQ8BU40 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nlrp4aQ8BU40 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nlrp4aQ8BU40 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nlrp4aQ8BU40 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nlrp4aQ8BU40 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlrp4aQ8BU40 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlrp4aQ8BU40 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlrp4aQ8BU40 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlrp4aQ8BU40 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlrp4aQ8BU40 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlrp4aQ8BU40 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlrp4aQ8BU40 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlrp4aQ8BU40 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrp4aQ8BU40 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrp4aQ8BU40 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrp4aQ8BU40 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrp4aQ8BU40 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrp4aQ8BU40 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrp4aQ8BU40 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrp4aQ8BU40 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrp4aQ8BU40 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlrp4aQ8BU40 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlrp4aQ8BU40 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrp4aQ8BU40 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrp4aQ8BU40 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrp4aQ8BU40 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrp4aQ8BU40 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrp4aQ8BU40 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrp4aQ8BU40 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrp4aQ8BU40 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrp4aQ8BU40 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrp4aQ8BU40 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrp4aQ8BU40 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrp4aQ8BU40 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrp4aQ8BU40 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrp4aQ8BU40 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrp4aQ8BU40 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrp4aQ8BU40 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms