Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHD4

Frmd3, FERM domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd3Q8BHD4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Frmd3Q8BHD4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Frmd3Q8BHD4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Frmd3Q8BHD4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Frmd3Q8BHD4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Frmd3Q8BHD4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Frmd3Q8BHD4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Frmd3Q8BHD4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Frmd3Q8BHD4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Frmd3Q8BHD4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Frmd3Q8BHD4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Frmd3Q8BHD4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Frmd3Q8BHD4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Frmd3Q8BHD4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Frmd3Q8BHD4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Frmd3Q8BHD4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Frmd3Q8BHD4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Frmd3Q8BHD4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Frmd3Q8BHD4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Frmd3Q8BHD4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Frmd3Q8BHD4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Frmd3Q8BHD4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Frmd3Q8BHD4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Frmd3Q8BHD4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Frmd3Q8BHD4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Frmd3Q8BHD4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Frmd3Q8BHD4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Frmd3Q8BHD4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Frmd3Q8BHD4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Frmd3Q8BHD4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Frmd3Q8BHD4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Frmd3Q8BHD4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Frmd3Q8BHD4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Frmd3Q8BHD4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Frmd3Q8BHD4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Frmd3Q8BHD4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Frmd3Q8BHD4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Frmd3Q8BHD4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Frmd3Q8BHD4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Frmd3Q8BHD4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Frmd3Q8BHD4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Frmd3Q8BHD4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Frmd3Q8BHD4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Frmd3Q8BHD4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Frmd3Q8BHD4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Frmd3Q8BHD4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Frmd3Q8BHD4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Frmd3Q8BHD4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Frmd3Q8BHD4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Frmd3Q8BHD4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Frmd3Q8BHD4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Frmd3Q8BHD4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Frmd3Q8BHD4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Frmd3Q8BHD4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Frmd3Q8BHD4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Frmd3Q8BHD4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Frmd3Q8BHD4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Frmd3Q8BHD4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Frmd3Q8BHD4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Frmd3Q8BHD4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Frmd3Q8BHD4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Frmd3Q8BHD4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Frmd3Q8BHD4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Frmd3Q8BHD4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Frmd3Q8BHD4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Frmd3Q8BHD4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Frmd3Q8BHD4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Frmd3Q8BHD4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Frmd3Q8BHD4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Frmd3Q8BHD4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Frmd3Q8BHD4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Frmd3Q8BHD4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Frmd3Q8BHD4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Frmd3Q8BHD4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Frmd3Q8BHD4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Frmd3Q8BHD4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Frmd3Q8BHD4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Frmd3Q8BHD4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Frmd3Q8BHD4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Frmd3Q8BHD4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Frmd3Q8BHD4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Frmd3Q8BHD4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Frmd3Q8BHD4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Frmd3Q8BHD4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Frmd3Q8BHD4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Frmd3Q8BHD4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Frmd3Q8BHD4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Frmd3Q8BHD4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Frmd3Q8BHD4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Frmd3Q8BHD4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Frmd3Q8BHD4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Frmd3Q8BHD4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Frmd3Q8BHD4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Frmd3Q8BHD4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Frmd3Q8BHD4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Frmd3Q8BHD4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Frmd3Q8BHD4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Frmd3Q8BHD4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Frmd3Q8BHD4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Frmd3Q8BHD4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.4 ms