Protein–RNA interactions for Protein: Q80U23

Snph, Syntaphilin, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnphQ80U23 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SnphQ80U23 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SnphQ80U23 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SnphQ80U23 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SnphQ80U23 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SnphQ80U23 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SnphQ80U23 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SnphQ80U23 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SnphQ80U23 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SnphQ80U23 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SnphQ80U23 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SnphQ80U23 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SnphQ80U23 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SnphQ80U23 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SnphQ80U23 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SnphQ80U23 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SnphQ80U23 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SnphQ80U23 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SnphQ80U23 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SnphQ80U23 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SnphQ80U23 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SnphQ80U23 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SnphQ80U23 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SnphQ80U23 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SnphQ80U23 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SnphQ80U23 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SnphQ80U23 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SnphQ80U23 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SnphQ80U23 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SnphQ80U23 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SnphQ80U23 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SnphQ80U23 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SnphQ80U23 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SnphQ80U23 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SnphQ80U23 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SnphQ80U23 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SnphQ80U23 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SnphQ80U23 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
SnphQ80U23 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SnphQ80U23 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SnphQ80U23 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SnphQ80U23 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SnphQ80U23 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SnphQ80U23 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SnphQ80U23 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SnphQ80U23 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SnphQ80U23 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SnphQ80U23 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SnphQ80U23 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SnphQ80U23 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SnphQ80U23 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SnphQ80U23 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SnphQ80U23 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SnphQ80U23 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SnphQ80U23 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SnphQ80U23 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SnphQ80U23 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SnphQ80U23 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SnphQ80U23 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SnphQ80U23 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SnphQ80U23 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SnphQ80U23 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SnphQ80U23 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SnphQ80U23 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SnphQ80U23 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SnphQ80U23 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SnphQ80U23 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SnphQ80U23 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SnphQ80U23 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SnphQ80U23 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SnphQ80U23 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SnphQ80U23 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SnphQ80U23 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SnphQ80U23 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SnphQ80U23 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SnphQ80U23 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SnphQ80U23 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SnphQ80U23 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SnphQ80U23 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SnphQ80U23 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SnphQ80U23 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SnphQ80U23 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SnphQ80U23 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms