Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TwistnbQ78WZ7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TwistnbQ78WZ7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TwistnbQ78WZ7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TwistnbQ78WZ7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TwistnbQ78WZ7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TwistnbQ78WZ7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TwistnbQ78WZ7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TwistnbQ78WZ7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TwistnbQ78WZ7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TwistnbQ78WZ7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TwistnbQ78WZ7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TwistnbQ78WZ7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TwistnbQ78WZ7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TwistnbQ78WZ7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TwistnbQ78WZ7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TwistnbQ78WZ7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TwistnbQ78WZ7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TwistnbQ78WZ7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TwistnbQ78WZ7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TwistnbQ78WZ7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TwistnbQ78WZ7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TwistnbQ78WZ7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TwistnbQ78WZ7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TwistnbQ78WZ7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TwistnbQ78WZ7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TwistnbQ78WZ7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TwistnbQ78WZ7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TwistnbQ78WZ7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TwistnbQ78WZ7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TwistnbQ78WZ7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TwistnbQ78WZ7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TwistnbQ78WZ7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TwistnbQ78WZ7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TwistnbQ78WZ7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TwistnbQ78WZ7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TwistnbQ78WZ7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TwistnbQ78WZ7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TwistnbQ78WZ7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TwistnbQ78WZ7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TwistnbQ78WZ7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TwistnbQ78WZ7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TwistnbQ78WZ7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TwistnbQ78WZ7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TwistnbQ78WZ7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TwistnbQ78WZ7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TwistnbQ78WZ7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TwistnbQ78WZ7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TwistnbQ78WZ7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TwistnbQ78WZ7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TwistnbQ78WZ7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TwistnbQ78WZ7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TwistnbQ78WZ7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TwistnbQ78WZ7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TwistnbQ78WZ7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TwistnbQ78WZ7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TwistnbQ78WZ7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TwistnbQ78WZ7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TwistnbQ78WZ7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TwistnbQ78WZ7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TwistnbQ78WZ7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TwistnbQ78WZ7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TwistnbQ78WZ7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TwistnbQ78WZ7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TwistnbQ78WZ7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TwistnbQ78WZ7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TwistnbQ78WZ7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TwistnbQ78WZ7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TwistnbQ78WZ7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TwistnbQ78WZ7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TwistnbQ78WZ7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TwistnbQ78WZ7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TwistnbQ78WZ7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TwistnbQ78WZ7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TwistnbQ78WZ7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TwistnbQ78WZ7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TwistnbQ78WZ7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TwistnbQ78WZ7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TwistnbQ78WZ7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TwistnbQ78WZ7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TwistnbQ78WZ7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TwistnbQ78WZ7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TwistnbQ78WZ7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TwistnbQ78WZ7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TwistnbQ78WZ7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TwistnbQ78WZ7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TwistnbQ78WZ7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TwistnbQ78WZ7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TwistnbQ78WZ7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TwistnbQ78WZ7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TwistnbQ78WZ7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TwistnbQ78WZ7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TwistnbQ78WZ7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TwistnbQ78WZ7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TwistnbQ78WZ7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TwistnbQ78WZ7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TwistnbQ78WZ7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TwistnbQ78WZ7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TwistnbQ78WZ7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TwistnbQ78WZ7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms