Protein–RNA interactions for Protein: Q62011

Pdpn, Podoplanin, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdpnQ62011 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdpnQ62011 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdpnQ62011 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdpnQ62011 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdpnQ62011 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdpnQ62011 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdpnQ62011 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdpnQ62011 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdpnQ62011 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdpnQ62011 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdpnQ62011 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdpnQ62011 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdpnQ62011 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdpnQ62011 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdpnQ62011 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdpnQ62011 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PdpnQ62011 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdpnQ62011 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdpnQ62011 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdpnQ62011 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdpnQ62011 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdpnQ62011 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdpnQ62011 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdpnQ62011 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdpnQ62011 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdpnQ62011 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdpnQ62011 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdpnQ62011 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdpnQ62011 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PdpnQ62011 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PdpnQ62011 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PdpnQ62011 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdpnQ62011 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdpnQ62011 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdpnQ62011 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdpnQ62011 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdpnQ62011 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdpnQ62011 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdpnQ62011 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PdpnQ62011 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdpnQ62011 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdpnQ62011 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdpnQ62011 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdpnQ62011 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdpnQ62011 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdpnQ62011 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdpnQ62011 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PdpnQ62011 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdpnQ62011 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdpnQ62011 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdpnQ62011 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdpnQ62011 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PdpnQ62011 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdpnQ62011 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdpnQ62011 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdpnQ62011 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdpnQ62011 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdpnQ62011 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdpnQ62011 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdpnQ62011 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdpnQ62011 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdpnQ62011 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdpnQ62011 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdpnQ62011 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdpnQ62011 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdpnQ62011 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdpnQ62011 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdpnQ62011 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PdpnQ62011 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdpnQ62011 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdpnQ62011 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PdpnQ62011 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdpnQ62011 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdpnQ62011 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdpnQ62011 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdpnQ62011 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdpnQ62011 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdpnQ62011 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdpnQ62011 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdpnQ62011 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdpnQ62011 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdpnQ62011 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PdpnQ62011 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PdpnQ62011 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PdpnQ62011 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PdpnQ62011 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PdpnQ62011 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PdpnQ62011 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PdpnQ62011 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdpnQ62011 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdpnQ62011 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdpnQ62011 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdpnQ62011 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdpnQ62011 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdpnQ62011 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdpnQ62011 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdpnQ62011 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdpnQ62011 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdpnQ62011 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdpnQ62011 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms