Protein–RNA interactions for Protein: Q61136

Prpf4b, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4bQ61136 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prpf4bQ61136 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prpf4bQ61136 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prpf4bQ61136 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prpf4bQ61136 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prpf4bQ61136 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prpf4bQ61136 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prpf4bQ61136 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prpf4bQ61136 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prpf4bQ61136 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prpf4bQ61136 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prpf4bQ61136 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Prpf4bQ61136 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prpf4bQ61136 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prpf4bQ61136 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prpf4bQ61136 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prpf4bQ61136 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prpf4bQ61136 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Prpf4bQ61136 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prpf4bQ61136 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prpf4bQ61136 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prpf4bQ61136 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prpf4bQ61136 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prpf4bQ61136 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prpf4bQ61136 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prpf4bQ61136 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prpf4bQ61136 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Prpf4bQ61136 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prpf4bQ61136 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prpf4bQ61136 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prpf4bQ61136 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prpf4bQ61136 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prpf4bQ61136 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prpf4bQ61136 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prpf4bQ61136 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prpf4bQ61136 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prpf4bQ61136 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prpf4bQ61136 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prpf4bQ61136 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prpf4bQ61136 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Prpf4bQ61136 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prpf4bQ61136 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prpf4bQ61136 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prpf4bQ61136 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prpf4bQ61136 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prpf4bQ61136 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prpf4bQ61136 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prpf4bQ61136 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prpf4bQ61136 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prpf4bQ61136 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prpf4bQ61136 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Prpf4bQ61136 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prpf4bQ61136 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prpf4bQ61136 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prpf4bQ61136 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prpf4bQ61136 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prpf4bQ61136 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prpf4bQ61136 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prpf4bQ61136 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prpf4bQ61136 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prpf4bQ61136 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prpf4bQ61136 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prpf4bQ61136 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prpf4bQ61136 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prpf4bQ61136 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prpf4bQ61136 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prpf4bQ61136 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prpf4bQ61136 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prpf4bQ61136 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prpf4bQ61136 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prpf4bQ61136 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prpf4bQ61136 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prpf4bQ61136 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prpf4bQ61136 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prpf4bQ61136 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Prpf4bQ61136 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prpf4bQ61136 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prpf4bQ61136 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prpf4bQ61136 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prpf4bQ61136 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Prpf4bQ61136 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prpf4bQ61136 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prpf4bQ61136 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prpf4bQ61136 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prpf4bQ61136 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prpf4bQ61136 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prpf4bQ61136 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prpf4bQ61136 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prpf4bQ61136 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prpf4bQ61136 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prpf4bQ61136 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prpf4bQ61136 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prpf4bQ61136 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prpf4bQ61136 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prpf4bQ61136 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prpf4bQ61136 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prpf4bQ61136 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prpf4bQ61136 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prpf4bQ61136 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prpf4bQ61136 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.3 ms