Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
9930111J21Rik1Q5SVP0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
9930111J21Rik1Q5SVP0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
9930111J21Rik1Q5SVP0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
9930111J21Rik1Q5SVP0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
9930111J21Rik1Q5SVP0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
9930111J21Rik1Q5SVP0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
9930111J21Rik1Q5SVP0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
9930111J21Rik1Q5SVP0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
9930111J21Rik1Q5SVP0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
9930111J21Rik1Q5SVP0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
9930111J21Rik1Q5SVP0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
9930111J21Rik1Q5SVP0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
9930111J21Rik1Q5SVP0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
9930111J21Rik1Q5SVP0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
9930111J21Rik1Q5SVP0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
9930111J21Rik1Q5SVP0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
9930111J21Rik1Q5SVP0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
9930111J21Rik1Q5SVP0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
9930111J21Rik1Q5SVP0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
9930111J21Rik1Q5SVP0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
9930111J21Rik1Q5SVP0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
9930111J21Rik1Q5SVP0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
9930111J21Rik1Q5SVP0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
9930111J21Rik1Q5SVP0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
9930111J21Rik1Q5SVP0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
9930111J21Rik1Q5SVP0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
9930111J21Rik1Q5SVP0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
9930111J21Rik1Q5SVP0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
9930111J21Rik1Q5SVP0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
9930111J21Rik1Q5SVP0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
9930111J21Rik1Q5SVP0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
9930111J21Rik1Q5SVP0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
9930111J21Rik1Q5SVP0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
9930111J21Rik1Q5SVP0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
9930111J21Rik1Q5SVP0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
9930111J21Rik1Q5SVP0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
9930111J21Rik1Q5SVP0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms