Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phf12Q5SPL2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phf12Q5SPL2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Phf12Q5SPL2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Phf12Q5SPL2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Phf12Q5SPL2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Phf12Q5SPL2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Phf12Q5SPL2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Phf12Q5SPL2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Phf12Q5SPL2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Phf12Q5SPL2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Phf12Q5SPL2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Phf12Q5SPL2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Phf12Q5SPL2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Phf12Q5SPL2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Phf12Q5SPL2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Phf12Q5SPL2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Phf12Q5SPL2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Phf12Q5SPL2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Phf12Q5SPL2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Phf12Q5SPL2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Phf12Q5SPL2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Phf12Q5SPL2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Phf12Q5SPL2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Phf12Q5SPL2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Phf12Q5SPL2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Phf12Q5SPL2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Phf12Q5SPL2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Phf12Q5SPL2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Phf12Q5SPL2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Phf12Q5SPL2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Phf12Q5SPL2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Phf12Q5SPL2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Phf12Q5SPL2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Phf12Q5SPL2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Phf12Q5SPL2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Phf12Q5SPL2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Phf12Q5SPL2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Phf12Q5SPL2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Phf12Q5SPL2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Phf12Q5SPL2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Phf12Q5SPL2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Phf12Q5SPL2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Phf12Q5SPL2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Phf12Q5SPL2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Phf12Q5SPL2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Phf12Q5SPL2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Phf12Q5SPL2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Phf12Q5SPL2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Phf12Q5SPL2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Phf12Q5SPL2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Phf12Q5SPL2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Phf12Q5SPL2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Phf12Q5SPL2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Phf12Q5SPL2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Phf12Q5SPL2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Phf12Q5SPL2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Phf12Q5SPL2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Phf12Q5SPL2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Phf12Q5SPL2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Phf12Q5SPL2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Phf12Q5SPL2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Phf12Q5SPL2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Phf12Q5SPL2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Phf12Q5SPL2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Phf12Q5SPL2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Phf12Q5SPL2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Phf12Q5SPL2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Phf12Q5SPL2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Phf12Q5SPL2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Phf12Q5SPL2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Phf12Q5SPL2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Phf12Q5SPL2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Phf12Q5SPL2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Phf12Q5SPL2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Phf12Q5SPL2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Phf12Q5SPL2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Phf12Q5SPL2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Phf12Q5SPL2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Phf12Q5SPL2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Phf12Q5SPL2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Phf12Q5SPL2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Phf12Q5SPL2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Phf12Q5SPL2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Phf12Q5SPL2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Phf12Q5SPL2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Phf12Q5SPL2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Phf12Q5SPL2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Phf12Q5SPL2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Phf12Q5SPL2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Phf12Q5SPL2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Phf12Q5SPL2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Phf12Q5SPL2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Phf12Q5SPL2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Phf12Q5SPL2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Phf12Q5SPL2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Phf12Q5SPL2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Phf12Q5SPL2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Phf12Q5SPL2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Phf12Q5SPL2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms