Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trdv2-2Q5R1A4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trdv2-2Q5R1A4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trdv2-2Q5R1A4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trdv2-2Q5R1A4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trdv2-2Q5R1A4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trdv2-2Q5R1A4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trdv2-2Q5R1A4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trdv2-2Q5R1A4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trdv2-2Q5R1A4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trdv2-2Q5R1A4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trdv2-2Q5R1A4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trdv2-2Q5R1A4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trdv2-2Q5R1A4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trdv2-2Q5R1A4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trdv2-2Q5R1A4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trdv2-2Q5R1A4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trdv2-2Q5R1A4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trdv2-2Q5R1A4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trdv2-2Q5R1A4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trdv2-2Q5R1A4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trdv2-2Q5R1A4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trdv2-2Q5R1A4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trdv2-2Q5R1A4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trdv2-2Q5R1A4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trdv2-2Q5R1A4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trdv2-2Q5R1A4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trdv2-2Q5R1A4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trdv2-2Q5R1A4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trdv2-2Q5R1A4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trdv2-2Q5R1A4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trdv2-2Q5R1A4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trdv2-2Q5R1A4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trdv2-2Q5R1A4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trdv2-2Q5R1A4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trdv2-2Q5R1A4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trdv2-2Q5R1A4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trdv2-2Q5R1A4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms