Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTU0

Afap1l2, Actin filament-associated protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afap1l2Q5DTU0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Afap1l2Q5DTU0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Afap1l2Q5DTU0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Afap1l2Q5DTU0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Afap1l2Q5DTU0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Afap1l2Q5DTU0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Afap1l2Q5DTU0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Afap1l2Q5DTU0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Afap1l2Q5DTU0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Afap1l2Q5DTU0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Afap1l2Q5DTU0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Afap1l2Q5DTU0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Afap1l2Q5DTU0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Afap1l2Q5DTU0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Afap1l2Q5DTU0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Afap1l2Q5DTU0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Afap1l2Q5DTU0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Afap1l2Q5DTU0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Afap1l2Q5DTU0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Afap1l2Q5DTU0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Afap1l2Q5DTU0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Afap1l2Q5DTU0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Afap1l2Q5DTU0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Afap1l2Q5DTU0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Afap1l2Q5DTU0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Afap1l2Q5DTU0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Afap1l2Q5DTU0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Afap1l2Q5DTU0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Afap1l2Q5DTU0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Afap1l2Q5DTU0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Afap1l2Q5DTU0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Afap1l2Q5DTU0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Afap1l2Q5DTU0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Afap1l2Q5DTU0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Afap1l2Q5DTU0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Afap1l2Q5DTU0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Afap1l2Q5DTU0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Afap1l2Q5DTU0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Afap1l2Q5DTU0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Afap1l2Q5DTU0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Afap1l2Q5DTU0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Afap1l2Q5DTU0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Afap1l2Q5DTU0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Afap1l2Q5DTU0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Afap1l2Q5DTU0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Afap1l2Q5DTU0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Afap1l2Q5DTU0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Afap1l2Q5DTU0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Afap1l2Q5DTU0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Afap1l2Q5DTU0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Afap1l2Q5DTU0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Afap1l2Q5DTU0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Afap1l2Q5DTU0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Afap1l2Q5DTU0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Afap1l2Q5DTU0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Afap1l2Q5DTU0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Afap1l2Q5DTU0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Afap1l2Q5DTU0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Afap1l2Q5DTU0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Afap1l2Q5DTU0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Afap1l2Q5DTU0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Afap1l2Q5DTU0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Afap1l2Q5DTU0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Afap1l2Q5DTU0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Afap1l2Q5DTU0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Afap1l2Q5DTU0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Afap1l2Q5DTU0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Afap1l2Q5DTU0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Afap1l2Q5DTU0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Afap1l2Q5DTU0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Afap1l2Q5DTU0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Afap1l2Q5DTU0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Afap1l2Q5DTU0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Afap1l2Q5DTU0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Afap1l2Q5DTU0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Afap1l2Q5DTU0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Afap1l2Q5DTU0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Afap1l2Q5DTU0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Afap1l2Q5DTU0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Afap1l2Q5DTU0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Afap1l2Q5DTU0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Afap1l2Q5DTU0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Afap1l2Q5DTU0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Afap1l2Q5DTU0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Afap1l2Q5DTU0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Afap1l2Q5DTU0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Afap1l2Q5DTU0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Afap1l2Q5DTU0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Afap1l2Q5DTU0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Afap1l2Q5DTU0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Afap1l2Q5DTU0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Afap1l2Q5DTU0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Afap1l2Q5DTU0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Afap1l2Q5DTU0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Afap1l2Q5DTU0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Afap1l2Q5DTU0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Afap1l2Q5DTU0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Afap1l2Q5DTU0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Afap1l2Q5DTU0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Afap1l2Q5DTU0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms